选药组方的目的是：第一，增强药物的协同作用，以提高临床疗效，例如黄柏、知母同用，可使滋阴降火的功效显著提高；第二，适应病情的需要，更好地照顾比较复杂的病证，如四君子汤是治疗脾胃气虚的常用方荆，若兼见气滞痰湿者，需加陈皮、半夏以理气燥湿化痰，名六君子汤，从而扩大了治疗范围；第三，调和偏胜，制约药物的烈性或毒性，以消除或缓和对人体的不利因素，如槟榔和常山配伍后，可以减弱常山的致呕作用。总之，选药组方要有利于临床治疗的需要，使方剂的配伍更加科学，并具有更明确的目的性。
那么怎样组方呢？组成一个方剂，不是把药效相同的药物堆砌在一起，而是根据病情的需要，在辨证立法的基础上，选择适宜的药物，规定必要的剂量，接着组方原则配伍而成的。这种组方原则始见于《内经》，即“君、臣、佐、使”。君药是指针对病因或主证而一起主要治疗作用的药物，如麻黄汤中的麻黄。臣药是指协助君药以加强治疗作用的药物，如麻黄汤中的桂枝。佐药有三个意义：其一，治疗兼证或次要症状的药物，如麻黄汤中的杏仁；其二，因君药有毒或药性峻烈需加以制约者，如十枣汤中的大枣；其三，反佐作用，反佐是特定的用法，它是“甚者从之”的意思，即用与主治药的药性相反的药物作为诱导辅佐，如四逆加猪胆汁汤中的猪胆汁，黄土汤中用黄芩。使药一般认为是引经药，具有引导诸药直达病变部位的作用，如参苓白术散中的桔梗。
另外，具有调和药性的药物也叫使药，如麻黄汤中的甘草。在每千方剂中，君药是不可缺少的。在简单的方剂中，臣、佐、使药则不一定都具备，因为有的方剂中的君或臣药本身就兼有佐，使药的作用。也有些方剂由于组成比较庞杂，而以生、次药来区别，不分君、臣、佐、使。至于一方中药味的多少，《素问·至真要大论》虽有“君一臣二，制之小也；君一臣三佐五，制之中也；君一臣三佐九，制之大也”和“君一臣二，奇之制也；君二臣四，偶之制也”的记载，但并不是呆板的规定，在临床上应根据辨证立法的需要而定。这样才能符台病情，发挥更好的疗效。但是，在方剂中，一般是君药少，而臣、佐药较多。
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