郑钦安根据《素问·生气通天论》中“阳气者若天与日，失其所则折寿而不彰，故天运当以日光明”之义，提出火神派最重要的学术观点就是重视阳气，崇尚扶阳。也就是说，在阴阳两纲中，他并非等量齐观，而是特别看重阳气，阳主而阴从。在人身各种阳气中，他又特别推重肾阳即元阳，认为是人身立命之根本，当然也是人体疾病善恶转化的关键。
1.阳统乎阴，阳主阴从
郑钦安认为元阴元阳是人身立命之根本，但是在阴阳两纲中，表面上看，阴阳在相互为用的关系中处于等同地位，互为消长，缺一不可。然而在相互消长的过程中，表现出的却是“阳统乎阴”“阳主阴从”的现象。因此他认为阴阳二者之间的关系，关键在于阳气，阳为主，阴为从，只有阳气致密于外，阴血才能固守于内。二者虽说互根，但又有主次之分。所以郑钦安特别重视阳气，认为“阳者阴之根”，“有阳则生，无阳则死”。郑钦安推崇辛热扶阳治法，擅用姜附等药，显然都是建立在注重阳气的理论基础之上。在其著作中，他反复阐述这些观点：
“阳者阴之根也，阳气充足，则阴气全消，百病不作。”
“阳旺一分，阴即旺一分；阳衰一分，阴即衰一分。”
“阳统乎阴，阳者阴之主也，阳气流通，阴气无滞。”
“人身所恃以立命者，其惟此阳气乎。阳气无伤，百病自然不作，有阳则生，无阳则死。”
“人身立命就是一个火字。”“人之所以立命者，在活一口气乎。气者阳也，阳行一寸，阴即行一寸，阳停一刻，阴即停一刻，可知阳者阴之主也”(《医理真传·卷二》）。
2.肾阳为本，人身赖之
“人生立命全在坎中一阳”，“坎中一阳”即肾阳，为人身阳气之本，立命之根，这是郑钦安在注重阳气的基础上进一步提出的观点。人身阳气有上中下部位之分，上焦有心肺之阳，中焦有脾胃之阳，下焦有肝肾之阳，但是，“下阳为上、中二阳之根”，下焦肾阳是上焦、中焦阳气之根。也就是说，在诸种阳气中，他又特别强调肾中阳气的作用，称之为“真阳”、“元阳”、“真火”、“龙火”。“肾中真阳为真气，即真火”，在其学说中，他亦反复强调这一点。
“少阴乃水火交会之地，元气之根，人身立命之主也。病至此际，是元气虚极，剥至于根……这一点元气澈上澈下，包罗天地”(《医法圆通·卷四》）。
“凡人之身皆赖一团真火”，“真气命根也，火种也。”“人活一口气，即此真气也。”
“有形之躯壳，皆是一团死机，全赖这一团真气运用于中，而死机遂成生机。”
“有形之躯壳，皆后天之体质，全赖先天无形之真气以养之。”
“人身立命，全赖这一团真气流行于六步耳。真气乃人立命之根，先天种子也”
(《医理真传卷二》）。
“夫人之所以奉生而不死者，惟赖此先天一点真气耳。真气在一日，人即活一日，真气立刻亡，人亦立刻亡，故曰人活一口气，气即阳也，火也，人非此火不生”
(《医法圆通·卷四》）。
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