中医的病因说，是古代医家在中医理论的影响下，在大量临床实践观察的基础上，借助类比等方法溯因而形成的，与西医沿“实体中心论”的思路，用还原方法去寻找各种疾病的特异性病因，并通过科学实验去发现和验证这些病因，有着本质上的差异。中医学的病因，是在对患者发病时证候的辨别、分析、综合的基础上，结合发病前患者生活状况及生活环境中的某些动态变化，对发病原因的回归性考察，偏重于宏观的、功能的、综合的、定性的研究。西医学的病因涉及疾病发生的外界因素、机体内部因素、自然环境及社会心理因素等多个方面，其中外界因素包括生物性因素、物理性因素、化学性因素和营养性因素等；内在因素包括神经内分泌因素、免疫因素、遗传因素、先天性因素和年龄、性别、种族因素；自然环境因素如季节、气候、大气、土壤和水等生态环境因素；社会心理因素包括社会制度、社会经济情况、社会文化变迁、社会结构、生活方式或行为、社会性灾害、社会心理状态等，另外还涉及医源性疾病。其对病因的认识主要依赖于多种检测的结果，偏重于微观的、形态的、分析的、定量的研究。
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