蜂蜜又称石蜜，虽由不同花粉酿成，品种自有差异，然其入药功能大致有五：清热、补中、解毒、润燥、止痛。此《本草纲目》所论。
多种慢性衰弱性疾病如溃疡、慢性肝炎、结核、甲亢、心衰等，多因五脏诸不足，蜂蜜补益之用众所周知，此不赘言。凡温热病必因郁热滞于体内，无论卫气营血之浅深，治疗均以解毒为主。《伤寒温疫条辨》之升降散及其加减变化而成之十五方，乃疫病及四时温病之重要组方。以蜂蜜及黄酒加水煎服，宣透郁热解毒效果明显。用黄连解毒汤治幼儿高热；用五味消毒饮、三蓼消毒饮治多种热毒证；用麻杏石甘汤治疗多种急性喘咳，均加蜂蜜煎药，实取其清热解毒润燥之功能，非仅取其调味之作用。经言诸惊痫痉之证，实指风痰热毒之浊邪。
家传治痔疮疼痛方：黄芪、泡参、当归、制乳没、升麻、炒黄柏、银花，加蜜与水煎服，有益气活血、解毒止痛之效，用于痔疮手术前后之疼痛。此方去黄柏加苏梗对某些长期不明原因之腹痛，所谓虚痛也有良效，也可用于虚性痛经。
以傅青主生化汤加生山楂、益母草、五灵脂以蜜为丸，治疗产后阴道出血、子宫复旧不全、产后瘀血所致腹痛低热，以及子宫肌瘤、子宫肥大等病症。
用小儿化食丹（神曲、麦芽、山楂、槟榔、莪术、三棱、黑白丑、熟大黄，以蜜为丸），治幼儿营养不良、厌食症、单纯性消化不良、便秘等病症，其消食化积、除疳止痢之效，尤胜于大山楂丸、保济丸等。
多种蠲痹止痛方药多伤胃肠，若用蜜丸，可缓其辛燥之性而宜长服；若欲汤剂如大乌头汤，必加较多蜂蜜同煎，存其祛风寒之专力，又去其毒性。用大黄、莪术、香附、当归、红花、柴胡、桃仁、丹参、五灵脂、丹皮、白芍以蜜为丸，治疗痛经、闭经，也用于气滞血瘀之黄褐斑。
蜂蜜入药，看似辅助之剂，然细思之，如多种蜜丸，若论剂量，已为主药。且无论清热解毒、补中益气、活血化瘀、滋阴壮阳等多种方药，皆可与蜜同煎，与蜜为丸，其除众病，和百药之功力，无药可及，即甘草亦无可及也。
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