一般来说，肝炎的愈后大多数是良好的，患了急性肝炎可以顺利恢复，不会演变成肝硬化或肝癌，不过确实有少数乙型肝炎病人长期不愈，逐渐发展成为肝硬化，最终极少数病例发展为肝癌。根据研究发现，肝硬化70%-80%是由慢性乙型肝炎发展来的。
国外有报道慢性乙肝表面抗原携带者发生肝癌的危险性比非携带者高200倍以上。95%以上的原发性肝癌中病人是由慢性乙肝表面抗原携带者演变而来的。为什么少数患乙型肝炎的病人，能够出现原发性肝癌的不良转变呢？其机理目前尚未完全弄清楚，因而也没有很有效的办法加以防止。
有的学者认为，既然乙肝病毒是罪魁祸首，那么防止乙型肝炎将有利于减少肝癌的发生，持不同意见的科学家则认为，肝癌发生的因素非常复杂，乙肝病毒只是始动原因。因为许多人感染了乙肝病毒，但毕竟发展成肝硬化，原发性肝癌的人仅仅是少数。乙防治疗乙肝肝炎固然非常重要，但是采取单一措施未必能解决问题，应该通过综合的措施乙防肝炎慢性化，防止癌变的发生。例如患了乙肝应尽可能早治疗，尽可能避免使用损害肝脏的药物，避免有害的物理因子刺激，X线和射性物质对肝脏的照射。
很多肝炎病人，在经历头痛、发热等类似感冒症状持续几天之后，又出现应尽可能减少或及早治疗各种感染，避免各种创伤和手术；麻醉、手术创伤都对肝脏功能恢复不利，必要时应尽量选择在肝功能恢复后在做手术；应尽量避免饮酒和过度劳累。发展成原发性肝癌的因素更加复杂，除了病毒原因之外，食物中的黄曲酶素、饮水中亚硝胺含量过多，密切接触某些金属如钼、铜、锌等，都与肝癌的发生有关系。
另外，肝癌的发生亦与机体的免疫力有关。正常人体内的细胞经常发生突变，可能形成癌细胞，但人体的免疫系统有清楚这些细胞的能力，因而人体不体质，增强人体的免疫力，也是防止肝癌发生的重要方面。会发生癌症。但人体免疫力减弱时，就容易发生癌变。
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