鼻咽癌的病因目前尚未完全明确，可能是多方面因素综合所致，与病毒感染、遗传因素和环境致癌物的刺激等因素有密切关系。病毒因素1964年和在对鼻咽癌组织研究中，培养出一种称为病毒的疱疹样病毒。此后一些学者又在鼻咽癌病人血液中检出病毒抗体，检出率达，从鼻咽癌活体组织培养的淋巴母细胞中也分离出病毒。
导致鼻咽癌的发生的原因
一、病毒因素：我国90%以上的人在年幼时都已感染过EB病毒，EB病毒的感染是十分普遍的。而鼻咽癌的发生具有明显的地区性，因此不能认为EB病毒的感染就是鼻咽癌的病因。但是在大量研究中又发现EB病毒与鼻咽癌的关系十分密切。尽管如此，EB病毒是不是鼻咽癌的病因，尚没有肯定下来。进一步的研究工作在进行之中。
二、环境因素：高发区居民嗜食当地的咸鱼、腌肉、腌菜，在这些食品中亚硝酸盐的含量特高并含有一定量的亚硝胺及其多种化合物。其中的二亚硝基哌嗪(DNP)已被证实可诱发小鼠鼻咽粘膜上皮不典型增生、原位癌、浸润癌，诱发率高达40%。说明亚硝胺及其化合物与鼻咽癌发病关系密切。
三、遗传因素：中医治疗鼻咽癌专家表示鼻咽癌的发病有明显的地区性，有明显的种族和家族聚集性。鼻咽癌好发于黄种人，很少见白种人患有此病。鼻咽癌发病高的家族如迁居海外，其后裔仍保持高发病率的倾向。鼻咽癌病人常有明显家族史。这些现象说明遗传背景在本病发生中起着一定的作用。
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