中国人视阴阳为万物本根，妙化之源。阴阳昭示了一种与西方哲学不同的宇宙观，并代表了一条中国特有的认识路线。
物质与运动的关系要重新定位
为了论证以阴阳为基本范畴的宇宙观和认识论，须要从头即从物质与运动的关系说起。
西方科学哲学，也是当今在中国居统治地位的哲学，将世界分为物质和运动这样两个最为根本的方面，强调世界是物质的世界，运动系物质在运动。就物质与运动的关系，可归纳为两个基本要点：1.物质和运动从不分离。2.运动是物质固有的属性。物质是体，运动是用；物质是本，运动是末。物质在运动中展示，运动不过是物质的存在方式。现代科学所说的信息虽然不等于物质本身，但仍然是物质运动的产物，是物质运动的一种方式。
基于以上看法，那么认识世界不外是认识运动与物质的统一，而统一的基础在于物质。就是说，认识世界归根结底是要认识运动着的物质，或物质如何运动。即使现代系统科学、复杂性科学，其实质仍然是以运动着的物质作为理论的出发点，所谓复杂系统和复杂性运动仍然是以现实存在的物质结构为基础，只不过在研究方法上具有极大的横向综合性和高度的抽象概括性。
这里所说的物质，是标示客观实在的哲学范畴。这种客观实在存在于人的感觉之外，可以直接或间接被人的感觉器官所感知。故物质作为客观实在总是处于与人的感觉并立相外的位置。
物质存在的这一基本性质决定了，它的具体存在方式必定是有形、有限的，同时它首先是一种空间存在，以空间性质为主、为本，以时间性质为次、为从。因为人的感觉器官的感知能力只能把握有形有限的事物。而一切有形体、有界限的存在，必定是空间性质占优势的存在，否则就不可能具有相对稳定的形体和界限而被人的感觉器官所感知。西方科学哲学着眼于世界的实体，视世界统一于物质，所以在观察世界时以空间为本位。或者也可以说，西方学者在观察世界时以空间为本位，故将物质实体视作世界统一的基础。
纵观古今，西方科学的理论和实践与上述哲学观念始终是相应的。不可否认，这其中包含了真理性，并且在人类认识史上确实创造了辉煌。但是，必须清醒地看到，上述关于物质与运动关系的看法不过是一种认识路线的产物，是不完善的，存在偏颇和缺失。
问题的关键在于，上述哲学没有充分估计运动和运动所形成的关系的独立意义。
世界的确存在物质和运动两个方面，而且这两个方面融合在一起，不可分离，以致没有真正的分界。比如就原子之间的化合与分解而言，原子是物质存在，化合与分解是原子的运动。然而，原子自身也充满运动，由质子、中子、电子之间的运动关系所构成。由此推出去，无不如是。因此，物质和运动的区分仅具有相对意义，不能简单地认为运动是物质的“属性”，物质派生运动。事实上，物质与运动既相融不分，又各具独立意义，可以说它们互为“属性”，处在相互派生之中。
运动的独立性还表现在，具体的物质存在是有限的，而由运动交织成的关系和联系是无限的。
物质是一抽象概念。实际中存在的物质，都是有具体性质的个体化的实物或物理场，无不具有自己的时空边界。但是，这些具体的物质存在在运动过程中，必定会与其他物质存在发生错综复杂的关系和联系。这些关系和联系即是运动的显示，运动的过程和体现。它们以自然整体的方式存在，没有时空界限，构成一个永恒变化着的杂错交织的整体运动关系之网。这个“网”是无限的，不可切割的，如果硬加切割，则会破坏宇宙整体运动联系的本来面目。
毫无疑问，这个宇宙运动关系之网与构成宇宙的所有物质存在之间，是相互应合的。但是，由于运动关系的复杂交错，彼此影响，它们与各有时空边界的具体物质存在不可能保持一一对应的关系。它们作为无限的运动关系之网，实质系宇宙的整体层面。这个无限宇宙的整体层面相对于各有时空边界的具体物质存在，自然具有了巨大的独立性和特殊的规律性，不为各具体的物质存在自身所固有。
我们知道，每一具体的物质存在都是一个相对独立的物质系统。该物质系统作为一个本始的整体，除了其物质构成之外，应当包括它自身在自然状态下固有的全部内部联系和与宇宙运动关系之网发生的所有外部联系。而这些物质系统在自然状态下的所有内部联系和外部联系，就是该系统的自然整体层面，它们都属于宇宙运动关系之网的一部分。物质系统的复杂程度越高，其整体层面的独立性和特殊规律就越是不能用其组成部分和物质构成来说明，而各个物质系统的自然整体层面与宇宙运动关系之网是连为一体的。
可见，实际中存在的物质与运动的关系，显示为无数有一定时空边界的个体物质存在与无限整体的宇宙运动关系之网的关系。物质和运动是宇宙中同时共存、又各具独立和特殊意义的两个实在的层面。这两个层面之间相互依赖，相互推动，相互决定，而绝不是仅由一方（物质）派生另一方（运动）。所谓物质进化，物质系统从低级到高级、从简单到复杂的发展，正是在宇宙运动关系之网的作用和制导下实现的，而且也只有在这样的运动关系中方能实现。
老子说：天之道，不争而善胜，不言而善应，不召而自来，然而善谋。天网恢恢，疏而不失。（《老子》第73章）
“天网”，即“天之道”，也就是宇宙运动关系之网。它究竟由什么来承载，通过什么来实现，在这里可以不具体讨论，因为运动和物质存在相融而不可分，运动是物质和其他一切实在（元气）的存在方式，物质和其他一切实在（元气）也是运动的存在方式。总之，运动和一切实在，“天网”和万物，虽各有自己的独立意义，但不是各占不同空间的两个东西。这里要辨明的是，运动和一切实在不过是宇宙存在的两面：从物质的角度看，宇宙由无数具体有限的个体实在所组成；从运动的角度看，它显示为无限不可分割的宇宙关系之网。
表面看起来，“天网”性虚，物质性实。天网不像物质那样有形可见，有体可察，但它无所不通，无所不及，无不包容。正是由它推展流形大化，运变万物生神。它虽然性虚，却并非无迹。天网之迹，其实就是万物在自然状态下变化着的现象。运动的自然呈现，就是现象。现象显示运动过程，它将一切运动关系物化、形化。所有交叉错综的运动关系都会通过现象综合地昭显出来，储存起来，发挥效能。现象即宇宙万物的自然整体层面，系各物质系统表里内外、上下左右相互作用所产生的反应和反映。现象的丰富性、变动性、随机偶然性，等等，正是根源于运动关系的复杂性、无限性和不确定性。现象就是“天网”的作用和明鉴。
现象作为宇宙万物的自然整体层面，绝不仅仅是事物的外部联系和物质实体的外在表现，更不是什么片面的、零碎的，其本身就有自己的规律和本体存在的独立意义，对宇宙演化发挥不可替代的作用。而现象的实质，也就是运动和运动所形成的宇宙关系之网。
阴阳是“天网”中起决定作用的关系
由于宇宙分为物质存在和运动关系之网两大对立层面，二者在存在方式上具有互斥性，一为无量之有时空界限的个体，一为统一之无时空界限的“天网”，因而认识就不可能同时以这两个层面为出发点，而必定或者以物质实体为本位来把握世界，或者以运动关系之网为本位来把握世界。这样就形成了对世界认识的两种选择。西方传统的认识论属于前者，中国传统的认识论属于后者。
认识层面的特点与认识方法的特点是相互对应的。
物质实体层面，其具体存在是有边界的个别事物。对这样的事物，根本上须要从相对静止的角度去观察，才能对它们的存在和变化做出明晰的刻画。而从相对静止的角度去看事物，人们看到的是整体由部分组成，部分决定整体。因此，对它们的认识就要从实体构成上去进行。于是，切割分解的方法，还原的方法势必成为基本的方法。对整体和过程的把握则须在分解还原的基础上来完成。
“天网”层面，其具体存在是各种运动过程和由它们所形成的无时空界限的极端复杂的整体联系。对这样的运动关系网，根本上必须从动态的角度去观察，才能对它们的存在和过程加以把握。而“天网”的呈现就是自然状态下的现象，故把握“天网”就要在自然的运动过程中观察现象。现象作为事物的自然整体层面是不容分割的，而在自然整体状态下观察现象，事物演进呈现整体产生和决定部分的过程。在这种情况下，要把握宇宙运动关系之网的本质和规律，实际就是要通过现象找出“天网”中那些起规定性、制导性作用的关系。正是那些“不争而善胜”，“不召而自来”，无所不及，无不包容的关系，推动事物演进，使整体产生和决定部分。
由于对宇宙存在层面的选择不同，西方人以物质实体作为认识世界的最基本的概念，而中国人以天道——天网作为认识世界的最基本的概念。西方人在物质实体中找到了原子、粒子，而中国人在天道——天网中发现了阴阳、五行。西方科学以物质原子为万物之本，中国科学则以天道阴阳为万物之本。
众所周知，阴阳不代表任何物质实体，是指某种运动状态及其所形成的关系。而这种状态和关系源于日、月、地三者的交错运动：
阴阳之义配日月。（《易传·系辞上》）
天为阳，地为阴；日为阳，月为阴。
阴阳系日月。（《灵枢·阴阳系日月》）
天地之动静，神明为之纲纪。（《素问·阴阳应象》）
受日照射为阳，受月照射为阴。天之影响为阳，地之影响为阴。日月往还，天地动静，就生出了阴阳交替。“神明”即指阴阳，阴阳成为规定天地万物运动变化最根本的规律，系世间一切妙化之源。
阴阳在大地上的本始表现即昼夜、四时。昼为阳，夜为阴；春夏为阳，秋冬为阴。这一过程直接显示为明暗、寒热的交替。明暗、寒热系阴阳的基本性态。从此基本性态出发，则引申出动静、进退、出入、升降、内外、显隐、伸收等动态关系，分属于阴阳两范畴。继而再将刚柔、水火、雌雄、仁义、南北、东西等的功能趋向赋予阴阳的属性。“水火者，阴阳之征兆也。”（同上）凡与水火相类的
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