在医药起源的问题上，存在着一种“医源于巫”的说法，这是不科学的，不仅夸大了巫的作用，而且还颠倒了中医药和巫产生的先后顺序。
首先，中医医药的产生早于巫。中医医药在有了人类之后就产生了，而巫的产生却远远落后于中医医药，是在原始社会末期产生的。原始社会的人们由于在日常生活中经常食用一些植物和动物，由此认识到了哪种植物和动物具有治病的作用，原始的中医药就因此产生。但是那时的生产力水平十分低下，人们对自然现象不会产生任何想法，只是自发地适应自然；等到生产力水平有所发展之后，人们才产生能够理解和控制自然现象的想法，但是对于自然现象并不了解，所以对自然现象做了歪曲的反映；直到原始社会末期，社会分工、私有制和剥削出现之后，巫才产生。
其次，巫给医药披上了迷信的外衣。有人之所以认为“医源于巫”、主要是因为他们以为中医药最初都是通过巫术的形式来给人们治疗疾病，其实并非如此。巫术产生之后，借鉴了中医药治病救人的方法，但是给它披上了迷信的外衣，并不是医源于巫，而是巫借鉴了医。巫是一种不科学的存在，而且进行着迷信的活动，它在巫术的名义下给人们治疗疾病，是对中医药的歪曲和不尊重。
所以中医药起源与巫的关系并不是像有人所说的“医源于巫”，这种说法不仅对中医药不公平，它没有看到中医药在历史长河中的实践和积累，而且还是对历史的歪曲，是一种不正确的世界观。怎样对待中医药的起源和巫的关系，这还关系到中医药的科学性问题，不能有一丝模糊。
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