覃氏瑶医在运用瑶医药治疗疾病方面，形成了自己独到的风格和用药特点。这里除有瑶医普遍性之外，还有覃氏瑶医的鲜明个性。
(一)瑶医融汇中医
覃氏瑶医文化水平相对较高，在覃孝章时代就已熟悉汉文化和中医，因此在那个时代就在应用瑶医经验过程中融人了中医内容。这对取长补短、提高疗效是很有意义的，同时由此也形成了覃氏瑶医的医疗用药风格。覃氏瑶医在诊疗上融汇中医进行诊治时，表现出了如下特点：
第一，在瑶医诊病整体上结合中医辨证
传统瑶医的概念是症宽于病，症是广泛的，包括了病，而病则是具体的，如同一痧症，其中包含了数十种痧病。所以瑶医治疗时具体针对的是病，只要病相同，则主专方治疗。这种治疗主张有其长处，但也有不足。而覃氏瑶医因熟悉中医辨证，因而在治疗实践中往往结合辨证用药处方，这对提高疗效起到了极大作用，在针对性基础上补充了灵活性。
第二，传统民间瑶药与中药结合使用
覃氏瑶医在熟知瑶药性能基础上，对中药充分吸收，这也形成了自身的医疗风格。其实，瑶药与中药可能是一种实物，可是因各自实践经验不同，对同一药物的性能主治则会有不同的认识。如中医认为是活血的药物，瑶医则认为是止咳。覃氏瑶医因熟悉中医，所以很早就结合中药知识进行用药处方。这对提高药物效果的准确性是很有意义的。
(二)小方与大方同用
瑶医强调专方专病，经验较固定，有什么病就用什么药方，针对性较强，而专方一般都药物种类较少，甚或还有许多单味药方。覃氏瑶医一方面重视这样的精专小方，在很多适宜的病情方面处以小方，如一枝花、九龙胆、一点血等单方。但是针对复杂病情，覃氏瑶医则主张大方治疗。因为复杂病情往往因素多，小方无法涵盖，必须以大方众多药物才能适应。所以覃氏瑶医的协定处方中也有很多是由几十味药组成的。
(三)内治与外治结合
覃氏瑶医认为，无论何种疾病，都可以内治，也可以外治。最好的办法是内外治法同用。因为病虽表现于外，但发于内，治内才可以除根。然而药物作用可以有多种途径，内服固然可以由内达外，外用也可以自外人内，内治外治不可偏废。在这一思想支配下，覃氏瑶医不但有内服的剂型，也总结开发了一系列外用贴膏，外用药物不仅仅只作用于外，对内部的消肿、止痛、利水也都有效验。而对皮肤病，似乎是外部疾病，然而仅用外治法并不完善，必须用内服药物以散风、祛湿、凉血、消斑以及调理气血脏腑方可奏效。
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