哈萨克医药的基本理论，是远古时期哈萨克人的祖先，在认识自然界的各种现象（如：天、地、明、暗、寒、热），及与各种自然灾害、人体疾病的斗争中，形成和发展起来的。
哈医用阿勒特吐格尔学说（六原学说）解释宇宙发生的一切，用六原（天、地、明、暗、寒、热）的相互资生，相互转化和依存，相互克制来解释物质及生命的起源、变化和转归。哈医认为六原之间的对立关系是构成人体温热、寒凉、松紧、软硬、动静、醒眠、吸收、排泄、干燥、稀湿十种物质平衡的基本原因。
哈医用六原学说解释人体生理、解剖、病理、病因、诊断、治疗、药物的属性、疾病的预防和饮食原则。六原是自然属性，也是构成宇宙的物质基础，六原的轮回、消长，促成了万物的萌发，生长和盛衰，它和人体保持着密切的相对稳定的平衡关系。这种平衡的失调，会造成人体的疾病，所以六原学说是哈医医药理论的核心，指导哈医药的一切理论和医事活动。
一、阿勒特吐格尔（六原学说）的基本内容
六原学说即哈萨克族传统的宇宙观。六原为肯斯特克（天、空间、位置）；吐热阿克（地、支柱）；加热克（光、明亮）；哈热阿恩格（夜、暗、未知物）；俄斯特克（热、温）；苏俄克（寒、凉、潮湿）。哈医理论用六原学说阐释人在宇宙中的位置和人与自然万物的关系；说明人体各个器官局部的固定位置及机能；说明人的情绪与外环境的关系；解释病因病理，及疾病部位和性质。
（一）六大原素的属性
六大原素按属性分为三对：
第一对：天、空间、位置（肯斯特克）热性
地、支柱（吐拉克）寒性
第二对：光、明、亮（加热克）热性
暗、夜（哈热阿恩格）寒性
第三对：温、热（俄斯特克）热性
寒、凉、潮湿（苏俄克）寒性
（二）六大原素是先天与后天之本
先天六大之本受于父母，生来俱有，与死同去，是人体生命活动的源泉，其生理功能维持到尽。它是整体的支柱，在生命活动中起主导作用，在增长进程中逐渐完善，并需要后天饮食和其他的补充将生命延续下去。
后天的六大之本是为了生存和把生命延续下去，是对先天之本的补充和维护，先天之本和后天之本是密切相关的，没有先天之本就无所谓后天之本，没有后天之本，先天之本也不可能生存下去。
哈医药理论中把先天之本分为六大部分：
布特木：指受精卵及组织胚胎的形成及出生后的有机整体。
阿尔哈吾：是指胚胎发育生长进程中，形成的元气及后天精微化生的水谷之气即人体的真气。
思吾：指胎儿在生长发育过程中，禀受的精、血、津液、羊水及后天饮食化生的体液总称。
黑木勒：胎儿在母体内开始的肢体和器官的功能活动及出生后整体及器官的功能活动。
吾什塔斯木：胎儿在母体内形成及出生后，外在十二器官和内在十二脏器经气、体液、吸收、活动、热能固摄之寒构成的有机整体。
阿吾加勒：胎儿在母体内形成、发育、生长过程中，母体内供胎儿的营养物质和母体所需的营养物质，经过器官的功能活动产生的精华（精、气、血）。
哈医理论中后天的六大之本就是人类能生存下去的物质基础：呼吸；语音、说话；住宅，包括故居和基地；保护身体的衣服；生产、生活中的劳动工具、武器及药物；人类繁衍后代。
（三）六太原素与器官之间的关系
哈医认为构成世界的六大原素，是人类赖以生存的基础，人属于六大原素，又从六大原素中摄取所需。
人体二十四个脏器器官和六大原素的关系：
肯斯特克（天、空间、位置） 外在的一一足、手
内在的一一心、口腔
吐热阿克（地、支柱）
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