1．伴随症状：脓尿伴有肾绞痛提示病变在肾脏见于肾结石，肾脓肿，多囊肾等伴有全身感染中毒症状提示上尿路感染。病史中应注意腰痛，膀脱刺激症状：尿频尿急、尿痛，尿液浑浊儿童有时以发热鼓肠形式出现，易误诊为发热待查。新婚女性易有便意感但粪便无论肉眼观察，还是镜下观察均为正常，而查尿方可发现异常容易误诊。
2．体格检查：肾区压痛叩击痛、上输尿管压痛点（腹直肌外缘平脐处）肋腰点压痛点腰大肌与十二肋骨交叉处）见于上尿路感染， 多囊肾合并感染时或上段输尿管梗阻大量肾盂积液时上腹可触及肿大的变形的肾脏。
3．实验室检查：脓尿菌尿是其特点尿液的常规检查除白细胞、脓细胞增加外，注意白细胞和脓细胞管型小圆上皮细胞存在代表上尿跟染。血常规白细胞总数及中性粒细胞增加。
慢性肾盂肾炎：脓尿常常间断出现注意反复验尿；有时须做尿液细胞计数称埃迪计数检查，每小时白细胞＞40万观万个或每1ml尿液＞2000个，或每分钟＞4000个均列为异常有时须做激发试验，静注氢化考的松 100mg，或氟美松5 mg或泼尼松30 mg，连用 3d，再做尿液白细胞计数较试验前增加一倍列为异常。尿液涂片找致病菌，可迅速做出诊断慢性肾盂肾炎注意肾功能的检查，肾小管功能持续受损最常见。
器械检查出超和CT检查对复杂性肾盂肾炎十分必要X线静脉肾盂造影对诊断慢性肾盂肾炎和复杂性肾盂肾炎有帮助，但患者对碘过敏或已有肾功能损害时应列为禁忌。
脓尿鉴别诊断：
1．肾盂肾炎：发冷发热恶心呕吐，全身酸痛等全身感染中毒症状，局部症状不同程度的腰痛膀腕刺激症状。实验室检查表现脓尿，脓细胞管型和白细胞管型特异性更高尿液涂片找菌或中段尿培养，不但可以发现致病菌，并可根据药敏试验指导用药是确诊的手段。区别上下尿路感染的常用实验室检查有：尿液抗体包裹细菌检查；尿酸测定如乳酸脱氢酸，过氧化酸谷草氨基转移酶，碱性磷酸酶，分葡萄糖昔酶溶菌酸等，以上特殊检查，上尿路感染时阳性下尿路感染时阴性。诊断慢性肾盂肾炎时，有时须做原浆型（L型）菌株培养L菌株是指致病菌在抗生素和机体抵抗力作用下，细胞膜破裂，细菌原浆质仍然保存这种菌的生命力持久，常常久治不愈，一有条件即可重新获得包膜生长繁殖，使感染复发。L菌株感染约占慢性肾盂肾炎20％它存在于肾髓质和肾乳头的高渗环境，故需高渗培养才会阳性。
2．膀胱炎：与肾盂肾炎相比较全身感染中毒症状少或无，而膀腕刺激症状更明显，膀胱三角区炎症易出现肉眼血尿一般无腰痛和肾区压痛叩击痛，部分患者有下腹膀脱区压痛。
3．肾脓肿：肾皮质多发脓灶融合扩大可向肾盂穿破，表现大量脓尿，临床表现高热不退肾区持续性疼痛、膀腕刺激症状。B超和CT检查肾脏可发现脓肿
4．肾结核：一般都是肾外结核继发而来常继发于肺、肠、盆腔等部位结核晚期常累及整个泌尿系统。X线检查一侧结核对侧肾盂积水是特点，尿中可找到抗酸杆菌可确诊值得注意的是久治不愈的脓尿要注意排除泌尿系统结核的可能。晚期的膀既结核，不但膀联刺激症状严重且膀脱容量小于50 ml是其特点
5．肾输尿管、膀脱结石：当结石在泌尿道移动时出现绞痛，划破或膜即易出现血尿并易合并感染B超r和CT线影像学检查可发现结石部位、大小、形状对诊断帮助较大当结石排出时患者可感觉到，甚至可看到排出体外的结石。合并结石的感染易久治不愈体外碎石治疗，疗效确切可使患者兔除开刀之苦，值得推荐
6．肾囊肿：肾是囊肿好发脏器之一可单发亦可多发。临床常见三大并发症：血尿、感染肾功能损害。若囊肿较大在上腹部可触到
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