先天性脊柱侧凸患者会并发许多其他畸形其中发生比例最高的是泌尿生殖系统的异常，如单肾，双输尿管交叉肾异位，尿路梗阻等等。除此之外还往往伴有许多其他异常如先天性心脏病，Spregel’s畸形， Klippell Feil畸形，Goldenhar综合症，全骶骨或半骶骨发育不全，肛门闭锁等。
还有不少患者合并有脊髓异常其中脊髓纵裂，脊髓栓系综合症是最常见的。因此对于先天性脊柱侧凸患者应全面检查作出正确诊断。对于先天性脊柱侧凸最重要的是判断侧凸的进展，但有时初诊时很难作出决定例如某些混合型畸形的患者因为同时存在多种畸形，包括半椎体，骨桥畸形不同的部位可能抵消了相互之间的作用而使脊柱达到平衡，进展可能性小。这样需要密切随访，对畸形进展的潜力作出及时而正确的评估。
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