北宋校正医书局校定刊行《金匮要略》凡两次。第一次刊行于治平三年（1066年），为大字本，见北宋治平三年国子监牒文：“治平三年三月十九日进呈，奉圣旨镂板施行（下为名录从略）”此牒文附于北宋绍圣三年牒文后。
第二次刊行于北宋绍圣三年（1096年），为小字本，见于绍圣三年国子监牒文，其中部分内容为：“朝旨开雕小字《圣惠方》等共五部出卖，并每节镇各十部，余州各五部。本处出卖今有《千金翼方》《金匮要略方》《王氏脉经》《补注本草》《图经本草》等五件医书，日用不可阙。本监虽见印卖，皆是大字，医人往往无钱请买，兼外州军尤不可得，欲乞开作小字，重行校对出卖，及降外州军施行，本部看详。欲依国子监申请事理施行，伏候指挥。六月二十三日奉圣旨。依奉敕如右，牒到奉行。都省前批六月二十六日未时付礼部施行。仍关合属去处主者一依敕命，指挥施行。”此牒文见清代叶德辉《书林清话》及明初吴迁《金匮要略》钞本，他本罕见。
北宋大小字本《金匮要略》均佚，《金匮要略》流传至今，端赖邓珍存亡继绝之功。邓珍，字玉珮，元代樵川人（今浙江南平市），仕履不详。邓珍从江西丘先生处得小字本《金匮要略》，据为底本，于后至元（1340年）刊行之，名《新编金匮方论》。从初刻至邓本相隔244年。
邓珍本流传路径不甚详明。清代大藏书家袁漱六的“卧雪庐”曾收藏之。袁漱六名芳瑛（？~1862年），湖南湘潭人，喜藏书，号称当代第一。其藏书室名“卧雪楼”，又名“卧雪庐”。袁漱六为道光二十五年（1845年）进士，与朱学勤（1823~1875年）、丁日昌（1823~1882年）并称咸丰三大藏书家。袁漱六的“卧雪庐”藏书之富，可与瞿绍基（1772~1836年）的“恬裕斋”、陆心源（1834~1894年）的“皕宋楼”、杨以增（1787~1856年）的“海源阁”相匹敌。袁漱六所藏十分之三得自乾嘉著名学者孙星衍（1753~1818年）。袁漱六卒后，其子好饮嗜博，家道败落，鬻书为生，大量藏书包括邓珍《新编金匮方论》在内为清末民初著名藏书家李盛铎（1859~1934年）的“木樨轩”购得。李盛铎写有如下题记：
题尚书司封郎中充秘阁校理臣林亿等诠次，晋王叔和集，汉张仲景述。半页十三行，行二十四字。标题双行大字。黑口，四周双边。前有高保衡、孙奇、林亿校定序一篇，又后至元庚辰樵川邓珍刊版序。收藏有“五砚楼”朱文长印，“袁印廷梼”白文，“寿阶”朱文二方印，“徐康”白文方印，“孙从添印”白文，“庆增”朱文连珠印，“石芝山房”朱文长方印，“贞节堂图书印”朱文方印。
邓珍本《金匮要略》今藏于北京大学图书馆，书号“李 3504”，为孤本。2014年，中医古籍出版社影印《仲景全书》，含赵开美翻宋本《伤寒论》、赵开美校定本《注解伤寒论》、宋云公《伤寒类证》、《金匮要略》。《金匮要略》正文前载邓珍本序，是赵本《金匮要略》为仿宋本无疑。光绪丁酉年（1897年）三月，杨守敬在上海寄观阁看到邓珍本，欣喜逾常，挥笔写有如下题记，盛赞赵开美本及邓珍本：“《金匮要略》以明赵开美仿宋本为最佳，次则俞桥本，然皆流传绝少，《医统》本则夺误至多。此元刊本与赵本悉合，尤为稀有之籍。光绪丁酉三月得见于上海寄观阁。因记。宜都杨守敬。”
《金匮要略》与《伤寒论》为从医之津涉，愈病之钤键，医理之渊薮，杏林之玉圃。振兴中医，实赖于此。
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