抗甲状腺药物治疗对某些人可以抑制骨髓白细胞(包括粒细胞、淋巴细胞、单核细胞等)生成或破坏外周血白细胞，从而引起白细胞减少，重者引起粒细胞缺乏。 在用抗甲状腺药物治疗过程中发生粒细胞缺乏，起病多为急骤，病人有高热、畏寒、咽痛、头痛及极度乏力；重者有口腔、咽峡、直肠、肛门、阴道或子宫粘膜坏死性溃疡，并可有败血症发生。
化验检查可以发现外周血白细胞数目多在2×109/升，甚至低于0.5×109/升，中性粒细胞百分比极度减少，常在0.05-0.1以下，有时中性粒细胞完全消失。
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