关于焦虑症的发病原因，不同学派有不同说法，有的学者强调杏仁核和下丘脑等情绪中枢和焦虑症的联系，边缘系统和新皮质中苯二氮蘧受体的发现，提出焦虑症的“中枢说”；也有人根据β-肾上腺素能阻断剂能有效地改善躯体的症状、缓解焦虑，支持焦虑症的“周围说”。心理分析学派认为焦虑症是由于进度的内心冲突对自我威胁的结果。基于“学习理论”的学者认为焦虑是一种习惯性行为，由于致焦虑刺激和中性刺激间的条件性联系使条件刺激泛化，形成广泛的焦虑。
就目前所知焦虑症的主要病因有：
一、遗传因素：在焦虑症的发生中起重要作用，其血缘亲属中同病率为15%，远高于正常居民；双卵双生子的同病率为2.5%，而单卵双生子为50%。有人认为焦虑症是环境因素通过易感素质共同作用的结果，易感素质是由遗传决定的。
二、病前性格特征：自卑、自信心不足，胆小怕事，谨小慎微，对轻微挫折或身体不适容易紧张，焦虑或情绪波动。
三、精神因素：轻微的挫折和不满等精神因素可为诱发因素。
四、生物学因素：焦虑反应的生理学基础是交感和副交感神经系统活动的普遍亢进，常有肾上腺素和去甲肾上腺素的过度释放。躯体变化的表现形式决定于患者的交感，副交感神经功能平衡的特征。
引发焦虑症的其他诱因：
1.躯体疾病虽然不是引起焦虑症的唯一原因，但是，在某些情况下，病人的焦虑症状可以由躯体因素而引发，比如，甲状腺亢进症、肾上腺肿瘤等。
2.认知过程，即人的思维，在焦虑症状的形成中起着极其重要的作用。
研究发现，抑郁症病人比一般人更倾向于把模棱两可的、甚至是良性的事件解释成危机的先兆，更倾向于认为坏事情会落到他们头上，更倾向于认为失败在等待着他们，更倾向于低估自己对消极事件的控制能力。在有应激事件发生的情况下，更有可能出现焦虑症。
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