如果隐睾位于腹股沟管内及腹内高位或者睾丸缺如临床检查常常摸不到睾丸。Levitt统计临床体检摸不到的隐睾约占全部隐睾的20％。对于这些病人常常先作HCG刺激试验即注射HCG1500IU，隔日1次，共3次注射前后检查血清中睾丸酮水平，如果注射后血清睾丸酮水平升高，表示有功能性睾丸组织存在如果注射后血清睾丸酮水平不变，常表示没有功能性睾丸组织存在。
对于临床摸不到的隐睾常常需要采用特殊的诊断方法来做隐睾的定位检查。B型超声波检查是目前最常用的方法，这种检查无损伤且可以同时检查病人有无肾积水畸形、结石等泌尿系统病变，对于腹股沟管内的隐睾有相当高的诊断率但对于腹内隐睾的诊断率还不够高。选择性精索内静脉造影是一个曾经广泛采用的方法，可从造影剂注入后的精索内静脉末端形态来诊断隐睾的位置或者睾丸缺如但常常由于静脉瓣影响了精索内静脉显影，而且对2岁以下的儿童操作很困难。电子计算机断层扫描（CTScan）和核磁共振（MRI）近年来也用于腹内隐睾的定位诊断均有相当高的准确性，Wolverson报告20例病人作CT检查，准确率达96％；Fritzche报告12例病人共15个隐睾经MRI证实14个隐睾1例高位误诊。这二种检查的缺点是在年幼的儿童检查比较困难而且费用很高。
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