厌氧菌通常有4 大类：
1.厌氧球菌 包括革兰阳性消化链球菌(peptostreptococcus)、消化球菌(peptococcus)、厌氧性链球菌(anaerobic streptococcus)和革兰阴性韦荣菌属(veillonella)。消化链球菌在肺胸膜感染中尤为常见。
2.革兰阴性厌氧杆菌 革兰阴性厌氧杆菌在肺部厌氧菌感染中很常见。类杆菌属占第一位，其次是梭杆菌属，偶有纤毛菌属。类杆菌属(bacteroides)中最常见的是脆弱类杆菌(B.fragilis)、产黑色素类杆菌(B.melaninogenicus)、口腔类杆菌(B.oralis)。梭杆菌属(fusobacterium)有核粒梭菌(F.nucleatum)、坏死梭杆菌(F.necrophrus)，多变梭杆菌(F.varium)和死亡梭杆菌(F.mortifemm)。
3.革兰阳性无芽孢杆菌 包括丙酸杆菌属(propionibacterium)、真杆菌属(eubacterium)、乳杆菌属(lactobacillus)、放线菌属(actinomyces)和双歧杆菌属(bifidobacterium)。在肺部厌氧菌感染中常见的有真杆菌、丙酸杆菌、迟缓优杆菌。
4.梭状芽孢杆菌 包括肉毒梭菌、产气荚膜梭菌、破伤风杆菌等，极少引起肺部感染。
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