旋毛虫病发病机制与机械性作用、过敏反应及中毒性损伤等三方面因素有关。成虫寄生于肠道引起消化道症状,幼虫移行造成血管组织、脏器损害。幼虫及其分泌物、排泄物导致过敏或中毒性病变。旋毛虫寄生部位的肠粘膜充血、水肿、出血或浅表溃疡。心肌呈充血、水肿改变,有淋巴细胞、嗜酸细胞浸润,并可见心肌纤维断裂和灶性坏死。骨骼肌以舌肌、咽肌、胸大肌、腹肌、肋间肌、腓肠肌受累最明显表现为间质性肌炎、纤维变形及炎性细胞浸润等。长久则可发生肌纤维萎缩。此外在肝、肾可见脂肪变形或浊肿胀改变。如侵及其他脏器则可造成相应的损害。
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