华支睾吸虫成虫寄生的肝胆管，其病变程度因感染轻重而异。轻者感染虫数少，从几条至几十条，肉眼未见明显病变。重者感染虫数多至数千条，病变明显。华支睾吸虫病的危害性主要是患者的肝受损。病变主要发生于肝脏的次级胆管。成虫在肝胆管内破坏胆管上皮及粘膜下血管，并将血液摄进消化道，一般认为血液是成虫的主要营养来源。虫体在胆道寄生时的分泌物、代谢产物和机械刺激等因素作用，可引起胆管内膜及胆管周围的超敏反应及炎性反应，出现胆管局限性的扩张及胆管上皮增生。病理研究表明：受华支睾吸虫感染的胆管呈腺瘤样病变。感染严重时在门脉区周围可出现纤维组织增生和肝细胞的萎缩变性，甚至形成胆汁性。由于胆管壁增厚，管腔相对变小和虫体堵塞胆管，可出现胆管炎、或阻塞性黄疸。由于华支睾吸虫占住胆管，肝管上皮增生、纤维化，使得管腔变窄，胆汁流出不畅，往往容易合并细菌感染。胆汁中可溶的葡萄糖醛酸胆红素在细菌性β-葡萄糖醛酸苷酶作用下变成难溶的胆红素钙。这些物质与死虫体碎片、虫卵、胆管上皮脱落细胞构成核心，并形成胆管结石。因此华支睾吸虫感染并发胆道感染和胆石症的报道很多，胆石的核心往往可找到华支睾吸虫卵。病理解剖与手术所表明胆囊炎、胆石症中有相当大的比例存在华支睾吸虫感染。华支睾吸虫病的并发症和合并症很多，有报道多达21种，其中较常见的有急性胆囊炎、慢性胆管炎、胆囊炎、胆结石、肝胆管梗阻等。此外，有报道华支睾吸虫的感染可引起胆管上皮细胞增生而致癌变，主要为腺癌。成虫偶尔寄生于胰腺管内，引起胰管炎。
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