阴茎癌的病因仍不十分清楚，但根据临床观察及统计数字表明，揭示阴茎癌的发病与包茎或包皮过长有密切关系。犹太民族男性新生儿，10天内行包皮环切术，未见有阴茎癌发生的病例。伊斯兰教民4～12岁行包皮环切术，患阴茎癌者极少。而成年后再行包皮环切术，则对阴茎癌无明显的预防作用。因此，阴茎癌可看作是一种包茎或皮过长的晚期并发症，也是一种可预防的肿瘤。阴茎头白斑，增殖性红斑可能癌变，但较少见。经常清洗、保持包皮腔的干净十分重要。
阴茎癌很少浸润尿道海绵体，故一般不影响排尿。阴茎癌恶性程度较低，发生转移较晚，转移途径主要经淋巴，最先出现的转移是沿包皮下层淋巴组织，转移至两侧腹股沟淋巴结，沿血流发生远处转移者，极少见。
阴茎癌最常见的发生部位是在包皮系带附近、阴茎头冠状沟、包皮内板及外尿道口边缘，极少发生于阴茎体。
阴茎癌的大体形态可分为原位癌、乳头状癌、浸润型癌和遗疡型癌。
原位癌：多位于龟头和冠状沟，是边界清楚的红色略突起的斑块，表面有脱屑或糜烂；有的表面为炎症性湿疹样改变，单发或多发，生长缓慢或数年不变。
乳头状(或菜花型)癌：常好发于包皮内侧、冠状沟及阴茎头部。开始为一空起的小乳头状瘤，可单发或复发；表面可呈结节状或乳头状分叶，高低不平。肿瘤渐渐增大，由于尿液浸泡肿瘤表面，常有感染。可溃烂呈典型的菜花样肿瘤，有脓性渗出物时具有特殊臭味。
浸润型(或结节型)癌：以冠状沟处较多见，其他部位亦有发生。癌肿表面呈结节状，有溃疡，有脓性或血性渗出液。
溃疡型：实是浸润型的一种，仅因肿瘤生长迅速，中央以大量坏死为主，而四周仍呈结节状隆起。此型肿瘤生长快，浸润深，更易发生淋巴道转移。
阴茎癌在早期，不论哪一型都很少侵及尿道，因尿道海绵体的白膜较为坚韧，能抵御癌肿的入侵，因此，排尿多无障碍。但到晚期，癌肿不但可侵及尿道，使尿道口受压、变形，尿道外口不易辩认，且可破坏整个阴茎。
不论是哪一型阴茎癌，多属鳞形上皮细胞癌，仅分化程度不同而已。阴茎癌的转移主要是经淋巴道。阴茎癌发生血道转移者少见，仅在晚期病例中才能见到。身体的任何部位都可转移，较常见的有肝、肺、脑和骨。
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