1.增生性病变鼻咽顶壁、顶后壁或顶侧壁见单个或多个结节，隆起如小丘状，大小0.5～1cm，结节表面黏膜呈淡红色，光滑，多是在鼻咽黏膜或腺样体的基础上发生，亦可由黏膜上皮鳞状化生后，角化上皮滞留而形成表皮样囊肿的改变，部分是黏膜腺体分泌旺盛，形成潴留性囊肿。当结节表面的黏膜出现粗糙、糜烂、溃疡或渗血等表现时，需要考虑癌变的可能，应予活检。
2.鼻咽黏膜炎症表现为黏膜粗糙，尤其是重度炎症时，鼻咽黏膜滤泡增殖，表面凹凸，甚至可呈桑椹样，表面附有脓性分泌物，常需与黏膜浸润性癌鉴别。
3.腺样体在鼻咽顶部呈隆起样改变，隆起部有前后纵向的浅沟若隆起样体积较小，称“腺样钵残留”，若鼻咽部反复炎症，腺样体增生以致堵塞鼻后孔，称“腺样体增生”。
4.变应性鼻炎鼻咽黏膜苍白、光滑，呈水肿样。
5.萎缩性鼻炎鼻咽顶前黏膜有浅在性溃疡，周围有脓性分泌物，需与溃疡型鼻咽癌鉴别。
6.恶性淋巴瘤鼻咽部出现结节状肿物，常常作活检才能与鼻咽癌鉴别。
7.鼻咽血管瘤多发生在鼻咽顶壁，肿块呈圆形或椭圆型，表面光滑，色深红。
8.鼻咽部淋巴肉瘤淋巴肉瘤好发于青年人，原发肿瘤较大，常有较重的鼻塞及耳部症状该病淋巴结转移，不单局限在颈部，全身多处淋巴结均可受累，颅神经的损伤不如鼻咽癌多见，最后病理确诊。
9.鼻咽部梅毒鼻咽部梅毒患者多有梅毒接触史，头痛较剧，伴有涕血，鼻阻。鼻咽部检查：可见黏膜溃疡，上有伪膜，涂片有时易找到梅毒螺旋体；血清学检查，康华反应阳性。对青霉素治疗有效。
10.鼻咽部结核患者多有肺结核病史，除鼻阻、涕血外，还有低热，盗汗、消瘦等症。体检：鼻咽部溃疡、水肿、肿胀、颜色较淡；分泌物涂片，可找到抗酸杆菌，可伴有颈淋巴结核；淋巴结肿大，呈马铃状，粘连，无压痛；颈淋巴结穿刺，可找到结核杆菌，OT试验强阳性，胸片常提示肺部活动性结核灶。
11.颅内肿瘤垂体瘤、听神经瘤等，可因头痛、停经、复视、面麻、突眼、视力减退等症状与鼻咽癌混淆，鼻咽癌亦常因有上述症状而误诊为颅内肿瘤。鼻咽腔内检查和CT检查可明确诊断。
12.慢性颈淋巴结炎急性颈淋巴结炎因发热、颈淋巴结红、肿、热、痛等感染症状与转移性癌极易区别，而慢性淋巴结炎肿大的淋巴结易与鼻咽癌颈淋巴结转移混淆，病史、淋巴结部位、VCA-IgA检测、鼻咽腔内检查、淋巴结穿刺等可助区别。
13.淋巴结结核好发于青壮年，常表现为营养不良、低热、盗汗等症状。颈淋巴结结核时肿大淋巴结为1～2cm大小，或者双侧颈上部同时有肿大淋巴结。临床上鼻咽检查、VCA-IgA检测、淋巴结穿刺有助于与鼻咽癌鉴别。
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