2004年以来，学校承担了各级各类科研项目602项，其中国家“973”计划、国家自然科学基金、国家“863”计划、“十五”国家科技攻关计划、“十一五”国家科技支撑计划等国家级项目21项，省部级项目123项。获得科研总经费6913.99万元。科研成果获各级各类奖励163项，其中国家科学技术发明二等奖1项、省部级奖励37项。开发了康莱特注射液、参麦注射液等单品种年销售额超2亿元的中药新药。共承担各级各类教改研究项目248项，在近两次教学成果奖评选中，学校获得国家级教学成果二等奖1项，省级教学成果一等奖2项、二等奖3项。
浙江中医药大学积极扩大国际交流与合作。2004年以来，学校先后与19个国家与地区的33个教育、科研、医疗单位建立了合作关系，招收了31个国家与地区的国（境）外学生1392人，有30多个国家与地区431批1935人次来校交流访问，选派了120批200人次赴20多个国家与地区参加学术会议、合作研究、医疗援外等。学校具有聘请外国文教专家资格，先后聘请了33位外国专家学者为客座教授。曾成功举办中医中药针灸诊治疑难杂病国际学术会议。
浙江中医药大学的建设和发展受到了党和国家领导人及各级领导的高度重视、社会各界的广泛关注。时任中共中央政治局常委、全国人大常委会委员长李鹏，时任中共中央政治局常委、国务院副总理李岚清，时任中共浙江省委书记张德江、习近平及教育部、卫生部多位领导都先后来校视察，对学校改革与发展的成绩给予了充分肯定。中央电视台也对我校进行了专题报道。
目前浙江中医药大学以提高质量为核心，以内涵发展为主导，以创建高水平中医药大学为目标，以“深化改革、科学发展、提高质量、增强能力”为指导，全面推进学校由教学型向教学研究型大学转变，努力为建设创新型国家、实现中医药现代化作出积极贡献。
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