周学文倡导“以痈论治”学术思想，将外科消、托、补法引入胃溃疡治疗，临床运用清热解毒、消痈生肌治法。
从脾论治，内清外柔理论的指导下创验方“血脂络欣”，健脾祛痰、化瘀通络治疗血脂异常。
胆汁反流性胃炎病位虽在胃，但肝胆疏泄失常、脾失健运、胆汁不寻常道是关键，周学文依此提出“肝脾并调，胆胃同治”的学术观点。
慢性肝损伤初为湿热夹瘀，久则毒损生积，通过清肝解毒、化湿通络综合治疗通常取得良好的临床效果。
周学文教授学医从医五十余载，医风清廉，医术精湛，曾先后师承名老中医徐荫堂、国医大师李玉奇等名医，擅长中医内科，精于脾胃病、肝胆病等消化系统疾病和内科疑难疾病的治疗，逐步建立并完善“溯源求本，内外相济，脏腑并调，尤重于脾”的源于临床、应用于临床的系统学术思想。
“以痈论治” 胃溃疡
胃溃疡一般归属中医胃痛范畴，胃痛又称胃脘痛，是以上腹胃脘部近心窝处疼痛为主症的病症。胃溃疡活动期临床表现以胃脘灼痛、反酸嘈杂，伴口干苦、舌红苔黄（黄厚），脉弦或弦数为特征。纤维胃镜可见圆形或椭圆形的溃疡，边缘常有增厚和充血水肿，底部覆盖灰黄色或灰白色的渗出物，周围黏膜可见有充血、水肿等表现。边缘光整，底部覆有灰黄色或灰白色渗出物，周围黏膜可有充血、水肿、糜烂等，周学文认为本病临床及病理表现可以用红、肿、热、痛四字概括，这与中医学外痈的临床特征很相似，故称为内痈，临床上应用“以痈论治”学术思想治疗消化性溃疡。
周学文认为毒热蕴胃是本病的常见证型，同时提出病由毒起，热由毒生的毒热病因学。毒热导致脾胃升降失调，气机不利，胃络瘀阻，进而损伤胃络，胃黏膜失养，热盛肉腐而成痈。其病邪的重点在于毒，其性属热。周学文运用“以效证因”的方法反证了毒热确为胃溃疡活动期的重要病因。
毒热为多因素的病邪，包括从口而入的毒邪、情志过极气郁化热蕴毒、胆汁不循常道逆流入胃化毒，交互作用而形成。毒热之邪属阳，热邪致病特点是易伤气血，易生疮疡。胃为阳腑，故毒热之邪易于侵及胃腑，损及胃络，故有局部胃黏膜红肿热痛之变。毒热病邪侵入胃腑，胃失和降，浊阴不降，影响于脾，脾不升清，则消化、吸收功能异常，胃肠动力障碍。毒热之邪导致胆气上逆，胆汁反流，邪在胆，逆在胃，肝胆之火，移入于胃，则毒热之邪导致胆胃之气上逆。另外，脾胃气机升降失常，常累及胆，胆胃同病，而表现为胆汁反流。毒热在胃，则可见吞酸嘈杂、口干口苦之症。热盛毒侵，气血凝滞，血肉腐败，而形成糜烂溃疡。毒热之邪也可致气血津液不足，毒热之邪久蕴，邪留伤正，势必导致脾胃运化功能减退，水谷精微生化乏源，气血津液不足，脏腑肢节失养，消瘦乏力，体质下降， 变生它病。脾气不旺，正气亏虚，机体无力驱邪外出，使毒邪加剧蔓延，正气继续耗损，病程缠绵难愈。
周学文在“以痈论治”的学术观点基础上，将外科消、托、补法引入本病的治疗，运用清热解毒、消痈生肌治法，取得显著的临床疗效。审因论治，以效测证，即控制致病因素或采取干预措施以验证病因，也是病因学研究的基本过程和方法。可能的致病因素被确定后，可采用干预控制方法验证病因。临床诊治胃溃疡活动期以毒热为病因，以胃毒热证为基本证候，以痈论治为基本治则，清热解毒、消痈生肌为基本治法，药物以黄连、苦参、三七、蒲公英等为主，重用黄连，佐以黄芪，愈合期和瘢痕期重用黄芪，佐用黄连的经验，并根据患者的伴随症状随证加减，同时规范患者调摄平素生活习惯，可以使致病危险因素消除或减弱，降低发病率，取得良好治疗效果。大量长期的实验研究结果表明，清热解毒、消痈生肌治法在一定程度上可以抑制幽门螺杆菌，保护胃黏膜，调节胃内PH值，减少胆汁反流，有效促进溃疡愈合。
基于中医临床防治重大、疑难病症的优势来研究、创新病因理论，审证求因，以效测证，将研究结果回归于临床，对进一步深入研究中医病因学理论，指导临床辨证施治，无疑具有重要的理论意义和应用价值。周学文研制的“溃得康颗粒剂”已获得国家中药新药证书。
“从脾论治，内清外柔”治疗血脂异常
血脂异常是指人体内脂蛋白的代谢异常，主要包括总胆固醇和低密度脂蛋白胆固醇、甘油三酯升高和（或）高密度脂蛋白胆固醇降低等。周学文根据临床大量病例观察与研究，提出“脾虚是本病的始动因素”和“从脾论治，内清外柔”的治疗方法。临床许多无症状的血脂异常病人，仅出现化验指标的异常脂质改变，此时的病机可理解为浊脂充斥于血脉，尚未累积人体脏腑组织而出现功能失调。如果血中浊脂积留过久则变生痰浊、瘀血，日久导致动脉粥样硬化等疾病状态。
“内清”的含义有二：一是清除人体内的有害物质，如痰浊、瘀血等；二是通过调整阴阳气血和脏腑功能，尤以调理脾的运化功能为主，减少浊脂生成。“外柔”其一是柔和血脉，即痰浊瘀血壅塞脉道，脉道受损，柔和血脉，脉道复则血脉畅；其二是通利脉道，因为痰浊瘀血内生积聚，络脉不畅。通利脉道，祛除内生之邪，则邪去而脉络通常，浊脂不能瘀积。具体方法可以采用化湿、降浊、活血、化瘀、化痰、通络、理气等。
周学文在从脾论治、内清外柔理论的指导下创验方“血脂络欣”，该方以黄芪、沙棘、山楂共为君药，黄芪补气健脾，沙棘实脾祛痰，山楂祛痰化瘀共奏健脾祛痰、化瘀通络之效，槐花、丹参为臣助君药活血通络，槐花亦可清肝热可缓络脉之急，三七、竹茹为佐药。诸药同用，从脾论治，内清外柔治疗血脂异常通常取得良好疗效。
“肝脾并调，胆胃同治”治疗胆汁反流
胆汁反流性胃炎是临床常见病、多发病，现代医学认为本病由胃-幽门-十二指肠协调运动失调，即十二指肠逆蠕动增加、幽门关闭功能减弱、胃排空延迟而使胆汁等十二指肠内容物过量反流入胃而导致。
胆汁反流临床常见且易反复，周学文经过多年临床观察与研究，认为本病病位虽在胃，但肝胆疏泄失常、脾失健运、胆汁不寻常道是本病的关键，进而提出“肝脾并调，胆胃同治”的学术观点。“肝脾并调”是指同时兼顾疏肝与健脾，需根据病情有所侧重。“胆胃同治”是指同时考虑利胆清热除湿与和胃、护胃。
周学文临证用药时，疏肝解郁常选柴胡、青皮、白芍、郁金等；健脾益气首选黄芪、白术；利胆清热除湿用黄芩、金钱草；和胃保护胃粘膜用白及、浙贝母、海螵蛸；痛甚涉及血分者用金铃子、元胡止痛，加丹参、三七活血；合芍药甘草汤降逆除满。
周学文创中药制剂“胆胃康”。研究结果表明，胆胃康能明显缓解、消除胆汁反流性胃炎临床症状，改善幽门功能，抑制反流，且能治疗胃粘膜炎症病变，临床试验总有效率93.3%，炎症好转率66.7%，有明显消炎利胆排石作用。
“毒损生积”，早期防治慢性肝损伤
目前，全世界约有3亿多乙型肝炎（乙肝）病毒（HBV）慢性携带者，其中我国约占1.3亿，约1/4的携带者将发展为慢性肝病。我国现有慢性肝炎患者约1200万，每年因肝病死亡人数约30万人。
慢性肝损伤临床常见，病程缠绵易生多变。周学文认为慢性肝损伤初为湿热夹瘀，久则“毒损生积”，依此提出“清肝解毒、化湿通络”综合治疗的学术思想。重视毒、湿、热、瘀、积的五毒传变，步步阻截，经多年反复临床验证以卷柏、苦参、黄芪等为主方治疗本病，不仅能改善肝功能、肝血液状态，同时改善肝纤维化指标，疗效显著。
“卷苦肝泰”是周学文在大量临床观察基础上，用清热化湿解毒以泻肝，行气活血以疏肝，益气健脾以养肝的治疗方法研制出的有效方剂。方中专门选择了入足厥阴、少阳血分的卷柏和味苦性寒之苦参。现代药理研究表明卷柏内含有黄酮酸性成分，少量鞣质，具有减少肠道细菌的作用，临床上多用来治疗腹痛、胃痛等症，并取得很好疗效。苦参是治疗慢性乙肝的常用药，内含多种生物碱，其主要成分是苦参碱，苦参碱有明显的抗病毒、促进肝细胞修复和免疫调节作用。二药一辛一苦，一温一寒，以防清热利湿再伤脾胃之弊。合用清热除湿、利胆退黄的龙胆草，活血行血之丹参共奏调肝解毒、补脾益气之功。
“审因求证、因证论治、通古博今”治疗内伤杂病
周学文对内科其他疑难疾病也积累丰富的临床经验。如喉科急慢性咽炎，其病因除呼吸道自身疾病外反流性食管炎亦可引起。针对本病咳嗽、咽痛、咳痰不爽，治疗易反复且易被忽视的临床特点，用肺胃同治的理论，拟“清热降逆利咽法”（以橘络、淡竹叶、川贝母、大青叶等为主方）。经临床验证，疗效良好，现已广泛应用于临床。
周学文认为口疮的发生与脾胃功能失调有关，其病理形态学改变为内痈范畴。周学文根据毒热内蕴证临床特点，提出“以痈论治”理论思想，以辨证论治为原则，拟定清热解毒、消痈生肌为基本治法，针对不同病人不同病症进行加减。
胃癌癌前病变是一个病理学概念，一般认为是指胃黏膜上皮中、重度不典型增生及不完全性肠化生而言。研究已表明有明显恶变倾向者可演变成胃癌，但需一个渐进的过程。根据本病的临床特征，多数人将其列入胃痞、胃脘痛等范畴。周学文主张以痈论治，且认为本病的发生多与饮食、情志、素体及邪毒等因素有关，多责之于脾胃虚弱、湿热邪毒、气滞血瘀，且多呈兼挟之势，病位在胃，与肝脾关系密切。在治疗方面脾胃虚弱证予六君子汤加减；肝胃不和证予柴胡疏肝散加减；脾胃湿热证予藿朴夏苓汤加减；胃阴不足型予一贯煎合芍药甘草汤加减。
周学文治疗痤疮从“运脾蕴之毒，清解内蕴湿热”入手，用黄芪、砂仁、白术益气健脾，化湿止泻，同时需防寒凉之品伤及脾胃；黄芩、胡黄连、败酱草清利湿热；野菊花、紫花地丁、栀子等祛颜面之热毒；甘草调和诸药，固护胃气。
周学文从“肝脾论治，肝脾同调”的角度入手治疗干眼症，良好疗效。
周学文用“眩晕当从肝论治，又不独责于肝”的思想指导眩晕治疗。脾乃后天之本，脾运化有节则气血生、痰湿
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