1911年至1949年民国时期，海峡两岸中医药的发展颇为艰辛与困难。但不论在北洋政府统治时期，或在国民党政府统治期间，或在日本占领台湾地区期间，都未能阻挡两岸同胞对祖国传统医药的传承、发展与交流，他们以各种方式和手段进行奋力的抗争。虽然中医药发展面临空前的困难，但是，海峡两岸中医界同仁仍然以各种形式传承和发展中医药，两岸中医药交流不断，充分体现了中国传统医药文化的凝聚力和亲和力，也体现了海峡两岸同胞的医缘与药缘。
民国时期(1911～1949年)，不论在大陆，或在台湾，中医学的发展都面临着生死存亡的时刻。面对当局各种倒行逆施的政策，海峡两岸中医界同仁，以各种形式进行了奋力的抗争与交流，并且竭力地传承与发展中医学。
时代背景
1911年至1949年，不论是北洋政府统治时期，还是国民党政府统治期间；不论在大陆，还是在台湾，中医学的发展都面临着空前的困难。
1912年，北洋政府教育总长汪大燮竭力主张废弃中医药。1914年，袁世凯提出“废止中医，不用中药”，汪精卫则主张“不但国医一律不许执业，全国中药店应限令歇业”。1927年至1949年国民党统治时期，对中医药也是采取废止政策。尽管在各地中医药界的强烈反对下，当局取消了废止中医议案，但1936年，有关主管部门公布的《中医条例》仍充满着歧视的内容。由于北洋政府、国民党政府妄图消灭中医的政策，使得大陆中医发展遭到严重摧残。
1895年的甲午战争，台湾被割让给日本。为了永久霸占台湾，消除台湾同胞的中华文化观念，日本侵略者强制推行各种“改革”。其中对中医采取自然淘汰制管理，即举办一次考试后不再许可的方式，使中医因死亡老残而自然逐年减少。因此，在日本侵台初期，曾对台中医师进行过一次考试，然后颁发许可证，并规定了许多限制；继而对中医采取扼杀、取缔政策，对具备行医资格的中医师，不发给执照，不准行医。据1897年的统计，土人医1070人，包括汉医1046人、洋医24人；而至1945年日本投降，台湾回归祖国时，台湾持有从事中医执业许可证者仅97人，台湾地区中医药事业受到日本侵略者的极大摧残。
民国时期，海峡两岸中医药发展都受到极大的摧残与限制，但是这些未能阻挡中华民族对中医药学的传承与宏扬，海峡两岸中医药的交流仍然不断。
中医教育交流
20世纪30年代，大陆中医药界一些团体与个人不顾当局的阻挠，相继兴办中医学校，力争中医学校加入教育系统，如上海有上海国医学校、中国医学院等；福州有私立福州中医专门学校、福州中医学社等；厦门有厦门国医专门学校等。这些中医学校的创办，吸引了大批有志于中医药发展的同仁，也吸引了许多台胞来大陆学习中医药。
在台湾，面对日本殖民统治当局的文化同化政策和思想奴化教育，广大台胞一刻也没有停止反抗日本文化殖民统治的斗争。他们以不同的方式同日本殖民主义者展开了长期的斗争，以维护中华民族传统文化和台湾本土文化。许多台胞甚至不畏艰辛，回到祖国大陆学习汉语、学习中医。当时广州、厦门、南京、上海、北京等地大学生中均有不少台湾籍学生。其中到上海国医学院学习中医的台胞有苏丰任、蔡荣华、钟金枝等；在吴瑞甫主办的厦门国医专门学校里学习中医药的有叶振成等。这些台胞通过学习中医药，增进了海峡两岸同胞对祖国传统医药的认同与传承，也体现了祖国医药文化的凝聚力和亲和力。
医事人员交流
民国时期，海峡两岸中医药界人士交往虽然规模不大，但从没有中断。日本占领台湾，使
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