纪晓岚是《四库全书》的纂修，始于乾隆三十八年(1773年），出任总纂官（总编辑）。纪晓岚穷十余年之力，带领一大批学者精心编纂《四库全书》，其中医家类排在子部，仅居儒家、兵家、法家、农家之后。在这一点上，纪氏是用过一番脑筋的。他在《济众新编·序》中写道：“农家医家，旧史多退之于未简，余独以农家居四，而其五为医家。农者，民命之所关；医虽一技，亦民命之所关，故升诸他艺上也。”这是纪昀唯一为医书做的序。
纪晓岚不是医家，他在文集中也常说“余不知医”，但每篇“提要”都极其精辟，能抉其精髓而持论公允，文字尤其简洁，简直是“前无古人，后无来者”了。
纪晓岚是“通儒”，平素对于医药，也颇为留心。如他的《槐西杂志》记录了骨折用开通元宝钱烧而醋淬，研末酒服的验方，如仓促间不得此钱，也可以用铜末。“丛此理之不可解者，铜末不过入胃肠，何以能透膜自到筋骨间”，“自结而为圈，周束折处”。“曾以一折足鸡试之，果接续如故，及烹此鸡，验其骨，铜束宛然”。又，瘾闭(小便不通）“百药不验”者，用蝼蛄（土狗子）煅灰酒服，即通。朱良春先生经验证实蝼蛄确有很强的利水消肿的功效。《滦阳消夏录》还有对于雪莲的记载，这是他被贬至乌鲁木齐四年中的见闻：“塞外有雪莲，生崇山积雪中，状如今小洋菊，名以莲耳。……此花生极寒之地，而性极热……积阴外凝，则纯阳内结。”
纪晓岚性格诙谐开朗，身体很好，他不能多饮酒，但特别爱吃肉，常常粒米不沾，大碗大碗地吃肉。他嗜茶，有茶星之名；好女色、更嗜烟如命，因而有“纪大烟袋”的外号。他的烟袋绝大，能装烟3～4两，每装1次，“可自家至圆明园，吸之不尽也”（《清朝野史大观》）。可能就是因为这些不良嗜好，影响了他的健康。嘉庆十年(1805年），他82岁时去世。
纪晓岚是近视眼，戴过眼镜，有诗记其事云：“暗中换索敢相夸，未老先看雾里花。眼作琉鹃君莫笑，尚愁人道是红纱。”语言诙谐，可以想见其人矣。
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