1、扁桃体炎性增生或周围脓肿有反复急性发作、高热、咽痛等病史，经抗生素治疗症状缓解或减轻，扁桃体虽大，但触诊不硬。
2、溃疡膜性咽峡炎、粒细胞缺乏性咽峡炎、咽结核、咽梅毒溃疡膜性咽峡炎 常发生于一侧扁桃体，有溃疡和假膜，涂片可找到梭形杆菌与螺旋体；粒细胞缺乏性咽峡炎以中年妇女较多，初起有周身不适、高热、咽痛和进食困难，颈淋巴结可肿大、压痛，扁桃体肿大，可发生溃汤，其上有坏死黑色物覆盖，查血象白细胞总数在0.5×109/L以下，粒细胞缺乏；咽结核为表浅溃疡，剧痛，常并发颈淋巴结结核或肺结核，涂片可见结核杆菌；扁桃体梅毒瘤的溃疡以陡边及基底污秽为特征，周围不硬结，血清康华反应阳性，活检可作鉴别。
3、扁桃体良性肿瘤 如纤维瘤、神经鞘瘤、脂肪瘤、单纯性涎腺混合瘤、黏液腺瘤、腮腺原发瘤、颈动脉体瘤等等，须作活检才能鉴别。
4、咽部何杰金病 为进程较慢的恶性疾病，它侵及全身淋巴结及脏器，有时可发生在咽淋巴环，偶有侵及扁桃体者，凭活检才能鉴别。
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