儿童癫痫外科治疗发展迅速，这其中手术治疗效果较好是起到了重要的促进作用。据报道，18岁以下的患者开颅手术83%可以达到完全控制，或发作减少90%以上。对于小儿癫痫的手术治疗总体来说，方法可以分为三类：致痫灶的去除、阻断癫痫通路的传导、增高癫痫阈值的手术。
一、前颞叶切除术：颞叶癫痫是难治性癫痫特别是小儿癫痫中最常见的的一类，也是最适合进行手术处理的一类癫痫，处理的方法多用前颞叶切除术，同时许多原发性癫痫也需要联合应用颞叶切除术。适用于本手术的病人为复杂部分发作或继发性全身发作、三种以上的药物增加到极量仍不能控制，致痫部位在一个颞叶。心理异常或严重的精神障碍是相对禁忌症，但这类病人如果有死亡或严重损伤的危险时同样可以手术；多部位癫痫或非颞叶癫痫不适合前颞叶切除。
二、大脑半球切除术：大脑半球切除术是儿童癫痫常用的方法之一，少用于成人，其选择标准包括：顽固性癫痫；病变半球对侧的偏瘫；所有的解剖与生理试验提示致痫区局限于偏瘫对侧有大脑半球，所有的解剖与生理检查提示偏瘫同侧的半球正常。此外还适合于大脑半球切除术的有婴儿偏瘫痉挛综合征、Rasussen综合症及Sturge－weber综合征。
三、致痫灶切除术：致痫灶切除术一直被认为是治疗颞叶外非功能区癫痫的最佳方式，但由于顽固性癫痫常常没有明显的结构异常，即无病灶癫痫，所以病灶切除术的应用受到限制。近年来随着新的检查方法的不断出现和改进，一些潜在的 “ 致痫灶 ” 检出率达到 90%上，从而使顽固性癫痫的病灶切除术又有了新的意义。
四、迷走神经刺激术：迷走神经刺激术于1994年得到欧洲的许可应用于临床，并确定其治疗的适应证是局部性癫痫，伴或不伴继发性的全身性癫痫发作，1997年得到美国食品与药物管理局的批准，并于1998年将该手术的适应证扩大到全身原发性癫痫。VNS是第一个采用植入方式治疗癫痫的手术，也是FAD近百年来第一个批准的治疗癫痫的方法。当前主要用于成人，小儿应用较少。
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