无论采用何种方法，都应准确寻找并确定内口，彻底切除感染的肛隐窝及肛门腺。这是确保肛瘘能够治愈、术后不复发的关键。
肛瘘是肛门直肠瘘的简称，是肛门周围的肉芽性管道。由内口、瘘管、和外口三部分组成。内口常位于直肠下部或肛管，外口在肛周皮肤上，可为一个或多个。经久不愈，间歇性反复排脓是其特点。
形成肛瘘的原因很多，绝大部分肛瘘是肛门周围脓肿破溃或切开排脓后，脓肿逐渐缩小形成的瘘道。另外，直肠肛门部的外伤、手术也可形成肛瘘。结核病、溃疡性结肠炎、克隆病、肛管直肠癌等疾病可并发肛瘘。但均较少见。
肛瘘的主要症状是瘘外口常有少量脓性、血性、粘液性分泌物流出，流出的分泌物刺激周围皮肤，使肛门部潮湿、骚痒不适，有时形成湿疹。如急性发作，或外口愈合时，瘘管中常有脓肿形成，可伴有发热、痛疼等症状。如不及时治疗，上述症状常反复发作，经久不愈。
根据瘘管位置与肛门括约肌的关系，可将肛瘘分为低位肛瘘和高位肛瘘。
低位肛瘘 瘘管位于肛门括约肌以下。低位肛瘘因不牵涉肛门括约肌，因此可直接切开、切除，术后不影响大便自制，一般不会有大便失禁并发症。
高位肛瘘 瘘管位于肛门括约肌以上。高位肛瘘因牵涉肛门括约肌，不能直接切开或切除，否则将造成大便失禁，需应用挂线疗法或分期手术，以确保肛门的自治功能。
肛瘘一旦形成，便不能自愈。这是因为：1.直肠内的污染物不断进入内口，内口持续感染。2.长期慢性炎症及反复感染，局部病灶形成纤维化管壁，管道常弯曲狭窄，致引流不畅。3.肛门周围支持组织，特别是括约肌的收缩，可致管道排脓不畅，使感染沿括约肌间隙蔓延。因此，一旦确诊肛瘘，即应手术治疗，并且要及时治疗，因为，病程越长，瘘管可能向四周蔓延，形成较多管道或较多外口，成为复杂肛瘘，这一方面给治疗带来困难，同时手术创伤、愈合时间也会相应增加。
由于肛瘘本质上是一个感染性管道。因此，肛瘘的治疗原则是将瘘管切开，形成敞开创面，促使愈合。手术关键是减少肛门括约肌损伤，防止肛门失禁，同时避免肛瘘的复发。千百年来，人们创立了各种治疗肛瘘的手术方法。但最长用的是以下三种方法：
1.肛瘘切开术 是将瘘管全部切开，靠肉芽组织生长使伤口愈合的方法。是传统的、可靠的方法。适合于低位肛瘘或高位肛瘘的低位部分。
2.挂线术 是利用橡皮筋或有腐蚀性作用的药线的机械性压迫作用，缓慢切开肛瘘的方法。其机理是通过紧线或弹力收缩，可以局部产生缺血性坏死而缓慢分离。在逐渐分离过程中，括约肌分离和组织的纤维化修复可同时进行。使分离后的肌端有附着点，从而缩小分离后两断端距离，减少功能障碍。挂线术用于治疗高位单纯性肛瘘或作为高位复杂性肛瘘的辅助治疗。
3.肛瘘切除术 切开瘘管，并将瘘管壁全部切除至健康组织，创面可不缝合或部分缝合。此法适合于低位肛瘘。
无论采用何种方法，都应准确寻找并确定内口，彻底切除感染的肛隐窝及肛门腺。这是确保肛瘘能够治愈、术后不复发的关键。
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