本病的病原菌是裴氏着色真菌，紧密着色真菌、疣状着色真菌、卡氏分枝孢子菌及皮炎着色真菌，其中以裴氏着色真菌引起者最常见。但脑脓肿综合症是由另一种暗色真菌毛状分枝孢子所致；囊肿皮下型为高氏瓶霉菌和曾氏瓶霉菌所引起。
着色真菌广布于自然界中，好腐生于潮湿地带，腐臭的树木或植物上。该病的发生与机体外伤密切相关，致病菌可以从伤口处侵入皮肤而感染。一般人与人之间不直接传染。当机体免疫功能降低时，可引发血行播散而累及脏器；本病的发生过程也与局部组织免疫有关，因皮损发生后，有时不经医治，部分病变也可逐渐自然痊愈。
着色真菌病在世界各国都有散发，但以热带、亚热带地区尤为常见。在我国1951年于山东省首次发现，随后吉林、辽宁、河北、河南、陕西、安徽、江苏、江西、广东、广西、北京及上海等省市皆有病例报道。其中在山东的章丘及河南之荥阳为主要流行地区。该病是一种慢性病可谓沉疴顽疾，常历经几年，甚至数十年而不愈。最后可使患者肢体致残，重症者还可危及性命，故对着色真菌病的防治应予以重视。
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