皮肌炎需与下列疾病相鉴别：
(一) 系统性红斑狼疮 皮损以颧颊部水肿性蝶形红斑指(趾)节伸面暗红斑和甲周为中心的浮肿性紫红斑、指(趾)间关节和掌(蹠)指(趾)关节伸面紫红斑以及甲根皱襞的僵直毛细血管扩张红斑有所区别；SLE多系统病变中以肾主要累及而皮肌炎以肢体近端肌肉累及为主、声音嘶哑和吞噬困难亦较常见此外血清肌浆酶和尿肌酸排出量的测定在皮肌炎患者有明显增高，需要时肌电图和肌肉活组织检查可资鉴别。
(二) 系统性硬皮病 皮肌炎的后期病变如皮肤硬化皮下脂肪组织中钙质沉着，组织学上也可见结缔组织肿胀，硬化皮肤附近萎缩等，但在系统性硬皮病病初期，有雷诺氏现象颜面和四肢末端肿胀、硬化以后萎缩为其特征、肌肉病变方面皮肌炎初期病变即已显著为实质性肌炎，而在系统性硬皮病中肌肉病变通常在晚期出现，且为间质性肌炎可作鉴别。
(三) 风湿性多肌痛症(polymyalgia rheumatica)通常发生在40岁以上，上肢近端发生弥漫性疼痛较下肢为多，伴同全身乏力患者不能道出来疼痛来自肌肉还是关节，无肌无力，由于失用可有轻度消瘦血清CPK值正常，肌电图正常或轻度肌病性变化。
(四) 嗜酸性肌炎(eosinophilic myositis)其特征为亚急性发作肌痛和近端肌群无力血清肌浆酶可增高，肌电图示肌病变化，肌肉活检示肌炎伴同嗜酸性细胞炎性浸润有时呈局灶性变化，为嗜酸性细胞增多综合征病谱中的一个亚型。
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