医学家对斑秃的发病原因迄今尚未完全明了。目前认为机体免疫功能的紊乱是其发病的主要原因，同时与精神神经因素、血管舒缩功能，遗传，内分泌失调，感染、中毒等有关。
一、自身免疫因素：
不少人认为斑秃是自身免疫性疾病，其理由有、早期斑秃患者在脱发部位毛囊下端有淋巴细胞浸润。
1、应用皮质类固醇激素可使脱发过程逆转，部分并发自身组织抗体的病例，治疗后抗体消失。
2、斑秃常与一些肯定的或可能的自身免疫性疾病并发，如桥本氏甲状晾炎，恶性贫血，自身免疫性溶血Addison病，特发性甲状旁腺功能低下，溃疡性结肠炎，低y-球蛋白血症，系统性红斑狼疮和白癜风等。
3、斑秃患者血清中发现抗体自身组织的抗体，如抗肾上腺抗体，抗平滑肌抗体等。
4、斑秃患者T淋巴细胞数与对照组相比有明显的减少，在有自身抗体的患者比没有自身抗体患者减少更多。
二、经精神因素：
精神因素常为诱发及促使病情加重的原因，有的病人在发病前长期焦虑，忧愁或悲伤，有的在精神紧张或情绪不安时发病，也有的在突然惊恐或悲痛之后迅速发生斑秃，医学发现，脱发患者有较突出的个性特征，41%以上的患者属内向和不稳定性格，70%以上患者有失眠多梦，入睡困难，早醒等睡眠失调，其发病机理可能是由于患者精神紧张，导致植物神经功能紊乱，交感神经紧张性增高，毛细血管持续性收缩，造成毛根部血液循环障碍，毛根种子层的细胞功能减退而发病。有人在动物实验中切除描及狗的第二颈神经节或神经根，相应的皮肤便成片的脱毛，这种实验表明，外伤性神经炎等神经系统的障碍可能成为斑秃的病因。
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