甲状腺功能减退症，一经确诊即需终身依赖甲状腺激素替代治疗，疗效较好，大多数病人经过治疗能生活自理坚持工作，因此，在治疗中不能自行停药或减量并积极预防应激(寒冷、感染、手术、外伤)状态发生。少数病人因粘液性水肿低体温昏迷，垂体危象而死亡。一旦发生危象必须急送医院进行抢救治疗。
许多甲减主要由自身免疫性甲状腺炎、缺碘、放射治疗及手术等所致如及早加以防止可减少发病，例如针对地方性缺碘者采用碘化盐并加强临床治疗等，其发病人明显减少，由药物引起者，应注意及时调整剂量或停用。
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