(1)外阴萎缩开始并不明显，在绝经2～３年后则很显著。首先是阴唇皮下脂肪减少，弹力降低，阴毛脱落变稀，大阴唇薄平，小阴唇缩小。随之阴道口的弹性也减少、缩小及扩张性差，前庭大腺的分泌物由少到无，更加重性交时阴茎插入时的不适和困难。
(2)阴道粘膜上皮细胞萎缩，表层细胞脱落，余下基底层细胞亦不再生长，变得菲薄脆弱，易受感染。粘膜上皮的渗出液由酸性变为中性，减低了阴道原有的抑制细菌生长的能力。尤其厌氧菌的大量出现，产生所谓的老年性阴道炎，在粘膜上皮下层有充血的红点。
(3)尿道粘膜随着雌激素的刺激也逐渐萎缩、变薄，往往在尿道口呈现一圈微血管，或者尿道粘膜外翻。尿道的横纹肌张力减退，容易出现尿失禁现象，特别在咳嗽、喷嚏或 用腹压时明显。
(4)乳房是性器官的一部分，虽然远离子宫和卵巢，却是雌激素依赖组织。更年期的早期常有乳房发胀感，但乳房组织，尤其皮下脂肪也在逐步萎缩使乳房下垂并失去张力， 不再高耸，当然更不会有分泌功能，若仍有分泌物，则需进行检查。
(5)体形的变化，在更年期开始进表现的是脂肪组织分布的改变，虽然加强运动锻炼可以不同程度地减轻肥胖及腹部脂肪增厚，但不可避免地会有一定程度的老年人的特征，如身材变粗，腰围线条消失，腹肌张力减弱，大腿皮下脂肪加多，面部出现的皱纺加多，眼下有卧蚕，唇上下细毛加多，以及皮肤上出现色素斑等。
(6)下丘脑和脑垂体因受不到雌激素的反馈抑制，大量分泌促卵泡素和其它促内分泌腺作用的激素，影响到身体其它的代谢功能。其中中钙和血脂的改变尤为明显，由此而改变骨的致密度和血管的弹性，引起严重危害妇女健康的另一些问题，如骨质疏松症、高血压及冠心病等。其意义远超出了更年期月经改变的范畴。
(7)中枢神经系统，尤其植物神经系统的功能，也会因更年期多种内分泌相互的影响，而出现短时或细或重的异常变化。特别是原来自我控制能力较差，或者反应比较敏感及强烈的妇女，容易有一时难于协调的行为或感觉，重时甚至与精神病发作难以区分。不过可以通过教育，明了其发生原因，或通过一些调理，使之很快自然减轻，最后完全恢复正常。
(8)其它如更年期好发的糖尿病、柯兴氏病及甲状腺功能改变，与雌激素的因果关系仍未有明确结论，尚需更多研究来澄清。
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