军团菌为细胞内感染，体外药敏试验常难以确切反映体内情况。理想的抗菌药物应在吞噬细胞内具有一定浓度，且在呼吸道分泌物中保持良好的穿透性，故目前治疗仍首选红霉素，每日1－2g，分4次口服，或静脉滴注，待病情缓解后该为口服，疗程通常为2－3周。亦可加用利福平，每日10mg/kg一次口服。氨基糖苷类及青霉素、头孢菌素类抗生素对本病无效。
治疗首选红霉素，每日1－2g，分4次口服，重症以静脉给药，用药2－3周。可以加用利福平，每日10mg/kg一次口服；多西环素每日200mg，一次口服，疗程3周以上，否则易复发。氨基甙类和青霉素、头孢菌类抗生素对本病无效。
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