流行性出血热流行有一定的地区性，但可扩展而产生新疫区。病例多呈散发性，也有局部地区爆发，多发生在集体居住的工棚及野营帐蓬中。国内疫区有河湖低洼地、林间湿草地和水网稻田等处，以前者为最多。感染与人群的活动、职业等有一定关系。
我国流行季节有双峰和单峰两种类型。双峰型系指春夏季（5～6月）有一小峰，秋冬季（10～12月）有一流行高峰。单峰型只有秋冬一个高峰。野鼠型以秋冬季为多，家鼠型以春季为多。除季节性流行外，一年四季均可散发。
野鼠型和家鼠型流行性出血热均有流行周期性，即数年出现一次流行高峰。流行高峰与主要宿主动物带毒率指数增高有关。
疫区分型：可分为姬鼠型，主要分布于亚洲，流行于秋冬季；家鼠型，分布较广，流行于春夏季；型主要分布于欧洲，流行于秋冬季；田鼠型分布于北美。
国内可分为野鼠型，主要分布于农村；家鼠型主要分布于城市和农村；混合型，指同一疫区兼有野鼠型和家鼠型流行性出血热流行。近年疫情趋势家鼠型逐年增多，疫区逐渐趋向混合型。
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