细菌侵入的感染灶并不明显，常不易找到，有时因检查不全面而被漏查，特别被衣服遮盖的部位如背部、骶尾部、四肢和腋下。足月儿和晚期新生儿（生后2～4周）临床症状有发热、拒食、神萎或烦躁不安，早产儿和低出生体重儿症状不典型。表现为拒奶、溢奶、不哭、不动、面色苍白、体重不增、体温不稳、有时体温不升。
除上列症状外，下列表现提示有败血症可能。黄疸加重或减退后又复现。有时黄疸可能是本症的主要表现。肝脾轻度或中度肿大，无其他原因可解释。瘀点或瘀斑不能以新生儿紫癜或外伤解释。严重败血症可出现中毒性肠麻痹，表现为腹胀，肠鸣音减低。或发生弥漫性血管内凝血、呕血、便血，或肺出血。
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