1．一般治： 同急性及慢性菌痢。
2．抗阿米巴治疗：根据病情选用下列药物之一。
（1）甲硝唑(灭滴灵)：成人0.4～0.6g，3/d，小儿15mg/kg，3/d，连用10d。不能口服者，可用0.5％注射液静滴；能口服时改口服。服药期间忌酒，孕妇及哺乳妇忌服。慢性病例，可采用保留灌肠。
（2）替硝唑(甲硝磺酰咪唑)：成人2g，儿童50mg/kg，每日清晨顿服，3d为一疗程。亦可用哌硝噻唑0.18，3/d，儿童10mg/(kg·d)，疗程7～10d，必要时连服1～2疗程。
（3）去氢依米丁(去氢吐根碱)：成人60～80mg，小儿lmg/kg，1/d，肌注，连用5～10d。毒性较盐酸依米丁为小，副作用较轻。
（4）盐酸依米丁(盐酸吐根碱)：成人60mg，小儿lmg/kg，1/d，肌注，连用6d。本品可致心肌损害及中毒性肌炎，治疗中应卧床休息，经常注意观察血压、脉搏、心电图，每次注射前听心音、测血压，如有改变，应考虑减量或停药。孕妇及心、肾病患者忌用。
（5）二氯散：0.5g，3/d，连服10d。
在应用上述药物一个疗程后，须选用下列药物之一，继续治疗。甲硝唑可单用。 ①磺碘喹啉：0.5g，3/d，连用10d。②双碘喹啉：0.6g，3/d，连服20d。③巴龙霉素：0.5g，4/d，7～10d为一疗程。
暴发型患者可选用依米丁3d，甲硝唑一疗程，同时加用诺氟沙星或妥布霉素或头孢曲松、拉氧头孢，以防治继发细菌感染。
3．中医药治疗： 单用或与其他抗阿米巴药物联合应用。①辨证论治：与细菌性痢疾同。②可因地制宜选用有效中草药如白头翁、鸦胆子、大蒜等。
4．带包囊者治疗： 可予二氯散0.5g，3/d，共10d；或用甲硝唑0.4g，3/d，共5d。
5．接触者进行医学观察必要时服甲硝唑一疗程。大便有变化时，应及时涂片或培养痢疾阿米巴原虫。
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