1、黄疸型病毒性肝炎
黄疸型病毒性肝炎有肝炎接触史，部分患者可有HBsAg阳性，黄疸呈肝细胞性黄疸，并伴有血清转氨酶升高，血清碱性磷酸酶一般不升高。对伴有黄疸的无痛性胰头癌初期患者，必须高度重视，及时明确诊断。
2、胆囊炎、胆石症
胆囊炎、胆石症腹痛呈绞痛的胰腺癌患者被怀疑为胆囊炎、胆石症，通常胆囊炎或胆石症为阵发性绞痛，黄疸常在腹痛发作后48小时以内出现，黄疸较轻，且经抗炎等治疗后多在短期内消退或有波动，而胰腺癌为持续性腹痛和进行性加重的梗阻性黄疸。
3、慢性胰腺炎
慢性胰腺炎有上腹饱胀、疼痛不适、腹泻、消瘦等症状，胰腺癌也可见到，临床上往往鉴别困难。慢性胰腺炎病程呈慢性反复发作史，X线片、B超、CT检查可发现胰腺部位的钙化点，有助于慢性胰腺炎的诊断。近来有文献报道，用ERCP可以对两者进行鉴别，胰腺癌患者可见胰管狭窄段>10mm，并伴有不规则的胰管扩张，而一般慢性胰腺炎的胰管狭窄段一般不超过5mm。
4、原发性肝癌
原发性肝癌常有肝炎、肝硬化病史。先有肝脏肿大，后期出现黄疸，血清AFP阳性，B超、CT检查可发现肝脏占位性病变。
5、Vater壶腹部癌
Vater壶腹部癌其与胰腺癌解剖位置相比邻，临床表现也十分近似。可以通过X线或ERCP检查来鉴别，Vater壶腹部癌常在X线片上可见有十二指肠降部内侧有黏膜紊乱、肿块压迹等现象，而胰腺癌常可见直接窥视到壶腹部的病变。
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