江西中医学院十分重视教育教学改革。始终把提升本科教育教学质量当作立校之基、发展之本，先后推行了改革教育教学模式的“教改工程”、激发学生学习动力的“素质教育工程”、提高课堂教学质量的“标兵工程”、改变教育管理手段的“数字化管理工程”等四大工程，有效促进了本科教学质量和办学水平的提高。根据省教育厅公布的数据，2005—2007年，江西中医学院本科毕业生就业率连续三年保持全省高校前三名，考研升学率连续三年居全省本科高校第一。近5年来，江西中医学院学生参加全国、全省大学生“挑战杯”、“数学建模”等课外科技创新创业设计大赛共获奖励120多项；在文艺演出、演讲比赛、英语竞赛、体育比赛等各种竞赛活动中获省级以上奖励180余项。
江西中医学院长期致力于探索“产学研”结合办学之路，形成了鲜明的“产学研”结合办学特色。学校创办并发展的江中（制药）集团拥有江中药业和中江地产两家上市公司，是中国OTC行业的领先企业。学校还高度重视科技成果转化工作，先后开发医药产品或功能食品100多个品种，其中，复方草珊瑚含片、健胃消食片、珍视明滴眼液、亮嗓胖大海清咽糖、杞浓果酒、金圣药物低害卷烟等6个产品，实现了单品种年销售额超亿元，为地方经济发展和社会全面进步作出了突出贡献。
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