1957年北京中医学院（北京中医药大学前身）刚刚成立，颜正华奉卫生部之命，调入北京中医学院任教，当时全校只有4位老师。颜正华一来就开始讲中药学课程，并负责组建中药学教研组，是教研组第一任组长。1958年，颜正华负责组建中药系，该中药系两年后发展成为北京中医药大学中药学院，是我国最早创建的中药高等教育院系之一。颜正华任中药教研室主任；1985年成立了中药研究所，颜正华任中药研究所名誉所长。
颜正华在中药教学中，以药物功效主治为核心，用性味归经等药性理论加以阐明，并结合临床讲授药物的配伍、用量、用法及禁忌等。他带领教师摘录文献卡片、编写中药学讲义、筹建了学校最早的中药标本室；还带领学生上山采药、制作标本。他的教学理念及方法，奠定了北京中医学院中药学科的教学基础。
在中药界，有“南凌北颜”之誉，说的是颜正华在上世纪60年代与成都中医药大学凌一揆教授共同构建了我国《中药学》教材的理论框架，拟订了我国中药学专业人才培养的基本模式。1959年，颜正华和凌一揆等主持编写了全国高等中医药院校第一版《中药学》教材。1963年颜正华主持修改审定该教材，习称“二版教材”，“五版教材”由颜正华担任副主编。《中药学》教材的问世，确立了当代高等中医院校中药教学的基本框架与内容，也奠定了颜正华成为我国新中国高等教育中药学学科的主要创始人和奠基人的地位。
从教53年，颜正华始终是我国编写、修改、充实、提高《中药学》教材的领军人物。1986年，他主编的《临床实用中药学》出版，成为全国医药人员学习中药的重要参考书。1991年，他主编的《高等中医院校教学参考丛书·中药学》出版，已经成为中药学专业权威范式。2008年，他主编的《颜正华中药学讲稿》出版，奠定了临床中药学的基本内容。现今，新世纪全国高等中医药院校“‘十一五’国家级本科规划教材”版本的《中药学》教科书，也是由颜正华主审的。他在长期的从医执教过程中，笔耕不辍，已出版的著作达600万字以上。
颜正华非常注重中药学科教师队伍的梯队建设，对身边工作的每个中青年教师都精心培养，在备课、试讲、编修讲义、撰文著书、临床治疗及实验研究等方面指导他们，使年轻教师迅速成长，中药教学整体水平居全国领先行列。2007年，这支教学队伍获得教育部国家级中药教学团队和北京市中药学优秀教学团队。
前些年，在北京中医药大学，时常可见一位白发苍苍的老人端坐在课堂上认真听讲、记笔记，老人正是颜正华。几十年来，他的每一个研究生、博士生或中药教研室的青年教师试讲，他都要坐在课堂上亲自听课、指导。
济世育人 繁茂杏林
执教53年，他带教徒弟及硕、博学生39人，培养的数以千计的中医药学子已成为杏林栋梁之才。他传岐黄薪火，堪为国医师表。
“看到自己的学生成为中医药事业栋梁之才，是最幸福的事情。”谈到学生桃李满天下，颜正华的脸上写满了自豪。
颜正华执教53年，为培养中医药人才呕心沥血。颜正华从1962年晋为副教授、1978年晋为教授、1979年为硕士生导师、1986年为博士生导师，先后为中医药专科、本科、西学中班、中药研究生班等数十个班次的几千名学生讲课及带临床实习；同时，颜正华先后带教了7名徒弟，培养了硕士研究生19人、博士研究生13人。
颜正华执教严明有方，不仅传授书本知识，还结合科研工作培养中药事业继承人。
在药性理论研究和应用研究方面，颜正华培养了一大批优秀中医药专家，如徒弟张冰是北京中医药大学博士生导师，博士生郑虎占是北京中医药大学博士生导师，徒弟
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