主要采用抗病毒治疗。治疗的目的主要是缓解症状，减轻疼痛，缩短病程及防止继发感染等。目前的治疗方法尚不能达到彻底清除病毒、消除复发的效果。
一、一般疗法
1、主要是保持局部清洁、干燥。可每天用等渗生理盐水清洗，疼痛者可口服止痛药，给予精神安慰。
2、并发细菌感染者，可外用抗生素药膏。
3、局部疼痛明显者，可外用5%盐酸利多卡因软膏或口服止痛药。
4、心理支持，说明疾病的性质、复发的原因和如何治疗及处理，增强与疾病斗争的信心。
二、抗病毒药治疗
推荐采用的治疗方案包括：阿昔洛韦，口服，每天5次；或阿昔洛韦，口服，每日3次；或伐昔洛韦，口服，每天2次；或泛昔洛韦，口服，每天3次。如果是初发生殖器疱疹，疗程为7～10天；复发性生殖器疱疹疗程为5天。频发复发者则需以较低的剂量服用较长时间的疗程。
预防
生殖器疱疹的预防有其自身的特点，要强调咨询和健康教育。
一、咨询
1、解释本病的自然病程，强调其复发性和无症状排毒的可能性，无症状期间也可发生HSV性传播；
2、告诉病人本病复发的常见诱因，避免心理紧张、郁抑或焦虑等不良情绪，通过避免复发诱因可减少复发；
3、告知育龄期病人（包括男性病人）有关胎儿和新生儿HSV感染的危险性；
4、告诉初发病人，抗病毒治疗可缩短病程，抗病毒抑制疗法可减少或预防复发；
5、取得病人对治疗的积极配合，以减少疾病的继续传播。
二、健康教育
1、强调病人将病情告知其性伴，取得性伴的谅解和合作，避免在复发前驱症状或皮损出现时发生性接触，或更好地采用屏障式避孕措施，以减少HSV传染给性伴的危险性；
2、提倡安全套等屏障式避孕措施，安全套可减少生殖器疱疹传播的危险性，但皮损出现时性交，即使使用安全套也可能发生HSV性传播；
3、改变性行为方式，避免非婚性行为，杜绝多性伴，是预防生殖器疱疹的根本措施。
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