少阳的定位在半表半里。半表半里在宏观的定位是表，即肌肤腠理、循环系统以里，胃肠道以外的结构范围，包含着全身的肌筋膜系统、淋巴系统与组织间液系统。
从细胞的角度，半表半里滋养着细胞的生长，支持细胞修复功能。细胞和细胞内的细胞器不是漂浮在细胞外液和内液中，而是被纤维蛋白丝固定在相对的位置上。网状蛋白丝汇聚并对多个细胞形成的组织器官进行分割包形成肌筋膜系统。肌筋膜连接微循环、细胞、细胞内部的细胞器，起到连接、支撑、包裹、物质交换、赋形等作用，是一个密闭、完整、封闭、连绵不断的整体系统。
根据三层表里观，少阳病为肌筋膜网及组织间液结构上的阳性病变，核心病机是细胞间基质——纤维系统张力增高，炎性反应增强，分布于半表半里的组织液增加，导致基质、纤维系统肿胀，张力增高，刺激邻近器官产生的一系列症状，脉象以左关脉弦或弦滑。由于肌筋膜网遍布全身，膜系统功能障碍多种多样，病理产物堆积可见于各处，故少阳病的表现千变万化。治疗以减小张力，降低代谢水平，舒缓筋膜为主，代表方为柴胡类方剂。
少阳病胸胁苦满症状的出现是因为病理产物在半表半里的筋膜系统堆积，刺激筋膜组织。虽然组织间液无处不在，但胸胁部位是包裹绝大多数脏器的胸膜、腹膜最集中的地方，故此部位症状最明显。同理，病理产物刺激淋巴、免疫系统，影响阳气表里出入会出现往来寒热；刺激胃肠，抑制消化功能则导致默默不欲饮食；刺激胃上口及纵隔部位，会出现心烦喜呕；循经上扰于上部孔窍则有口苦、咽干、目眩等；刺激部位不同则出现不同或然证。
少阳病主方是小柴胡汤，柴胡是专属疏通筋膜的药物，但只用于半表半里的阳证。在柴胡疏通筋膜的基础上，加用黄芩则可清除肌筋膜网内的病理产物。疏通筋膜的阻塞需要从里部调集能量，所以又用到了生姜、大枣、甘草。筋膜之邪较表部之邪更深，需要调集更多能量，故加用人参。若筋膜发病理产物偏于浊腻，令人喜呕，则加半夏降逆化湿。
厥阴病与少阳病病位相同，其提纲和少阳病提纲成镜像对照，是以全身筋膜网络（细胞间基质—纤维系统）功能低下为主的病变。细胞间基质—纤维系统功能低下，则处于里部的细胞代谢产物不能有效地排入血液循环系统进而排出体外。
厥阴病是半表半里的阴证，核心病机是分布于半表半里组织的组织液减少，纤维筋膜系统萎缩、痉挛，代谢水平低下，脉象以左关脉弦伴有沉细无力为主。治疗以加强基质、纤维系统代谢水平，增加组织间液分泌，舒展、壮大筋膜系统为主。在半表半里功能活动失调的过程中，会出现表、里、半表半里三部功能振奋的不同步，又因局部热量、张力的过快增长，故会伴发整体功能低下基础上的局部亢进，即寒热错杂。
厥阴病代谢产物的堆积会刺激局部出现热证。故厥阴病的主方乌梅丸中既有大量振奋机能的温热性药物，又有黄连、黄柏等清理代谢产物和炎症物质的药物。若厥阴病仅表现为功能低下而代谢产物堆积不明显，也可暂时不用黄连、黄柏而以温阳药为主，待厥阴功能改善，左关脉逐步有力后再逐渐加入清热药，此时病情多转为少阳，可合用柴胡剂化裁。若左关脉细弱，可用当归芍药散活血、养肝、利水；若左关脉为纯阴脉，是为久寒，可用吴茱萸汤加减化裁。无论养肝血、疏肝郁、清肝火抑或是暖肝阳，经方扶阳法尤其重视脉象对诊断的指导作用，而不仅仅依赖症状。这样可以避免误判，且有长远疗效。
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