我国古医籍《黄帝内经》、《伤寒杂病论》、《千金要方》、《类经》、《脉经》等医著中，多处用“医圣”一词，根据所查资料，最迟在南宋、金代已有尊仲景为“大圣”、“亚圣”、“圣人”的明论。至清初则被赞为“医圣”而名扬于世。
金代医家成无已在《伤寒明理药方论 自序》中评：“惟张仲景方一部，最为众方之祖。是以仲景本伊尹之法，伊尹本神农之经，医帙之中，特为枢要。参今法古，不越毫末，实乃大圣之所作也。”赞仲景为“大圣”。刘完素在《素问玄机原病式·序》中曰：“夫三坟之书者，大圣人之教也。法象天地，理合自然，本乎大道。仲景者，亚圣也。”南宋医学家陈自明评论同代人李自建的《伤寒十劝》一书时说：“今有李子建作《伤寒十劝》。虽未能尽圣人之万一，其中多有可取，亦不出活人之书。”李子建《伤寒十劝》是对《伤寒论》学习的认识体会，“圣人”指张仲景。可见此时尊仲景为“圣人”之说已定，仅有“大圣”与“亚圣”的区别。
明清时，则众辞共赞仲景为“医圣”。清顺治十三年（公元1656年），南阳府丞张三异重修医圣祠时立碑识曰：“先生讳机字仲景……谥医圣，南阳人。”至此，“医圣”大彰于世。后人多用“医圣”代仲景表示敬意，清代医学家魏荔彤在《伤寒本义》中说：“伤寒例，叔和修缉医圣之书，发其凡例也。”
尊仲景为医圣的原因，是由于他品德高尚，才学过人，可为后学者楷模，因而可和前代圣人相比而赞为后圣。如金人严器之说：“夫前圣有作，后必有继而述之者，则其教乃得著于世矣。医之道源自炎黄，以至神之妙，始兴经方；继而伊尹以元圣之才，撰成《汤液》，……后汉张仲景，又广《汤液》，为《伤寒杂病论》使数卷，然后医方大备。兹先圣后圣，若合符节。”此段文字从炎黄推论到伊尹、到仲景，说明经方的兴、盛、备、而发出“前圣后圣，若合符节”的议论。
将仲景与孔子并提，仲景方书于儒学六经对言。此说盛于明、清之时。王肯堂《伤寒准绳序》曰“黄岐犹羲文也，仲景其孔子乎。”张志聪在《伤寒论宗印序》中说：“医学始乎轩岐，立方立法，原于仲景本论，故曰，仲景犹孔子，岂臆说哉!”清代医学家陈修园说得更为明确：“医门之仲景，儒门之孔子也。”孔子为儒门之圣人，医林中人将仲景与之相，而称赞为医门之圣。
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