胃肠神经官能症是植物神经功能失调所引起的以胃肠系统症状为主要表现的一种功能性疾病。现代医学在治疗此病时，常常是对症治疗，而中医中药在治疗此病时积累了丰富的经验。具体选方用药时需强调明辨虚实寒热，治疗则重视调理气机为主。
虚寒体质者常表现为畏寒、腹胀、食少、脉沉，或见腹痛剧烈，或有呕吐，腹部冷凉，可扪及痉挛的肠曲，甚则手足厥冷。常是因中阳不足、阴寒内结所致，治则当温补中阳、散寒破结为主，方可用大建中汤（干姜、川椒、人参、饴糖），服药后进热粥，加被静卧。
寒实体质者常表现为畏寒、腹胀、大便秘结、脉实，或见上腹部疼痛剧烈，大便不通，舌苔白腻或灰腻，脉弦紧。常是因寒实内结，腑气不通所致，治则当散寒破结、通腑理气为主，方可用大黄附子汤（大黄、附子、细辛），便通则痛止。
若情志抑郁，性情易怒，可见腹泻前腹痛，泻后痛减，伴胸胁满闷、嗳气、喜叹息、脉弦者，常因肝气犯脾、肝脾不调所致，治则当理气开郁、调理肝脾为主，方可用痛泻要方（白芍、白术、防风、陈皮），缓缓调之。
若脾胃虚弱、食少、大便不调、腹痛间断发作，伴有心胸烦热、口干、呕吐、腹中冷、舌苔黄白相兼者，常因中阳不足、寒热错杂、气机升降失序所致，治则当温补中阳，散寒清热、宣通气机为主，方可用黄连汤（黄连、干姜、桂枝、半夏、人参、炙甘草、大枣）。
若胃肠道功能紊乱日久，时常腹痛，心悸，汗出，手足烦热，咽干口燥者，常因中阳不足，气血亏虚，阴阳失和，宜补益中气、调和阴阳为主，方用黄芪当归建中汤（黄芪、当归、桂枝、芍药、生姜、大枣、饴糖、炙甘草）调理。
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