一、西医常见的病因有：
1. 反复感冒，鼻炎、鼻窦炎可引起慢性咽炎，较常见。
2. 牙齿疾病、慢性扁桃体炎以及呼吸道疾病也常导致咽炎。
3. 嗜烟、酒，生活或工作环境的多尘、多刺激性气体，以及无节制地高声长谈或唱歌等，亦可引发本病。
二、中医与脏腑失调、虚、痰、瘀内生有关：
1.肺胃肾阴虚：过食辛辣炙煿、烟酒，用嗓过多或烟尘、高温、气候干燥等，耗伤阴津，虚火内生，上炎于咽，灼伤肌膜。
2. 痰浊上犯：过食肥甘、嗜烟喜酒、空气污浊，滋生痰浊，上犯咽喉。
3.气血瘀阻：情志失调，忧郁悲怒，肝气不舒，气滞血瘀，阻于咽喉。
除了中西医病因分析，还可以综合多方面因素，归为以下三类：
外界因素：生活地域气候寒冷、干燥，工作环境空气被粉尘、化学气体污染，烟酒、辛辣饮食长期刺激，都易得慢性咽炎。
局部因素：急性咽炎反复发作，可转为慢性。邻近器官疾病，如慢性扁桃体炎、牙跟炎、龋齿、慢性鼻炎、慢性鼻窦炎等炎性分泌物流入咽部，或慢性鼻病造成鼻通气困难而用口呼吸；以及咽部长期受刺激而呈慢性炎症改变。
全身因素：长期生活不规律；疲劳、精神紧张，使身体抵抗力下降；细菌和病毒容易反复感染。过敏体质的人对外界环境、气候的改变过度敏感，容易感冒，引起咽炎。
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